2022-12

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Rosettaを用いたデノボタンパク質デザイン手法をレビュー

タンパク質のデノボデザインに有用な計算手法について概説されたレビュー論文を紹介します。
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反復らせん構造に基づくペプチドバインダーデザイン

反復したらせん構造の主鎖骨格を使って、ペプチド結合領域をデザインする手法を紹介します。
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Rosettaのエネルギー関数まとめ

Rosettaで使用されるエネルギー関数において参照される、各エネルギー項の算出式を主に解説した論文を紹介します。
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抗ウイルス薬の包括的データベースを機械学習で分析

ウイルスに対するワクチン・抗体・化合物の情報を、vitroの活性から知見情報まで、多面的かつ網羅的に格納したデータベースを紹介します。
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深層学習を活用した結合界面予測手法PINetとは

深層学習を活用して、特定のリガンド・レセプター間の相互作用界面領域を予測するための手法、PINetを提案した論文を紹介します。