2022-05

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【Rosetta】Pythonで扱えるRosetta分子モデリングツールの解説

RosettaパッケージをPythonベースで実装した、PyRosettaについて解説した論文を紹介します。
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【抗体モデリング】抗体に特化した側鎖構造予測手法PEARSについて

抗体の側鎖構造を予測するツールであるPEARSを紹介します。
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【抗体スクリーニング】天然配列へのback mutationで、抗体のdevelopabilityが改善

不溶性を示す物性の悪い抗体に対して、計算予測で物性を改善する変異体のデザインに成功した論文を紹介します。
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【抗体エンジニアリング】抗体のdevelopabilityに関与する物性指標とは

メルクの非臨床における抗体スクリーニングのプラットフォームと、それを活用した各種物性評価指標の相関に関する解析結果を紹介します。
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【抗体デザイン】in silicoで抗体の物理学的性質を予測する手法を解説③

抗体の物理学的性質をin silicoで予想する手法を紹介します。
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【Foldit】これまで作ったペプチドをFolditで操作してみた

Folditでタンパク質をデザインしてみました。
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【抗体デザイン】in silicoで抗体の物理学的性質を予測する手法を解説②

抗体の物理学的性質をin silicoで予想する手法を紹介します。
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【抗体デザイン】in silicoで抗体の物理学的性質を予測する手法を解説①

抗体の物理学的性質をin silicoで予想する手法を紹介します。
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【ワクチン】中和抗体を誘導できるワクチンをde novoデザインするツール TopoBuilderを解説

標的エピトープに結合する抗体価の上昇を目的に、適切なワクチンをde novoデザインする手法、TopoBuilderを紹介します。
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【抗体de novoデザイン】CNNを利用した抗原結合抗体の分類モデル

抗原結合抗体を判定する深層学習モデル、DLAB-Reを紹介します。