2023-01

Articles

【レビュー】深層学習を活用したタンパク質デザイン手法を総括

深層学習を活用したタンパク質デザイン手法をレビューした論文を紹介します。
Articles

【タンパク質デザイン】タンパク質の計算機デザインに貢献した研究者たち

タンパク質をデノボでデザインするための研究を、歴史を追って概説したレビュー論文を紹介します(②)。
Articles

【タンパク質デザイン】タンパク質の計算機デザインの歴史を学ぶ

タンパク質をデノボでデザインするための研究を、歴史を追って概説したレビュー論文を紹介します。
Articles

【Rosetta】ヘリックス・ループのタンデム構造をパラメトリックにデザイン

ヘリックス・ループ・ヘリックス・ループのタンデム構造を、パラメトリックにデザインする手法を紹介します。
Articles

【Rosetta】CCDを利用したループ閉鎖法について紹介!

タンパク質の構造予測時のループ閉鎖に、CCDを適用した手法を紹介します。
Articles

【配列デザイン】CNNでタンパク質の主鎖構造から配列をデザイン

タンパク質の主鎖構造から、深層学習を利用して、配列をデザインする手法について紹介します。
Articles

【バインダーデザイン】MDシミュレーションで生成した訓練データを活用してMonobodyをデザイン

深層生成モデルを利用して、Monobody型のバインダーをデザインする手法"Sculptor"を紹介します。
Uncategorized

【ディスプレイシステム】酵母を使ったlibrary-on-libraryスクリーニング手法を紹介!

酵母ディスプレイシステムを使って、library-on-libraryのスクリーニングをハイスループットに実施する手法を紹介します。
Articles

【遺伝子オントロジー】配列からタンパク質の機能を説明する文書生成技術を紹介!

タンパク質の配列情報から、その機能を説明するテキストを生成する、深層学習モデルについて紹介します。
Articles

【グラフニューラルネットワーク】タンパク質構造をグラフ表現するためのPythonモジュールGrapheinについて

生物学的なデータを機械学習に供するためのグラフ表現を、柔軟かつ簡便におこなうためのPythonライブラリ、Grapheinを紹介した論文です。