Articles 【デノボデザイン】pH依存的にフィラメント形成を促す自己集積タンパク質をデノボデザイン
pH依存的にフィラメント形成を誘導するヘリカルタンパク質をデノボデザインした事例を紹介します！
2024-05
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Articles 【Foldseek】タンパク質複合体の構造アライメントにおすすめ、Foldseek-Multimer について
タンパク質複合体の構造アライメントを高速に行えるツール Foldseek-Multimer を紹介します！
Articles T cell engager の活性を最大化させるコツを構造から考察します
T cell engager の活性が 2 つの Fv の連結角によって大きく異なり得ることを、構造的な観点から考察した論文を紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】RifDock で TLR3 バインダーをデザイン
TLR3 に対するデノボバインダーデザインを実施した事例を紹介します！
Articles 遺伝子・タンパク質の部位変異予測手法まとめ
遺伝子の部位変異予測効果を予測する手法を情報整理し、新たに手法を開発する際の公開ガイドラインをまとめた文献を紹介します！
Articles 拡散生成モデルを活用したヘリックス構造生成でGPL-1アナログをデザイン
HelixDiff という拡散モデルで、ヘリックス構造を生成する手法を紹介します！
Articles Direct Preference Optimization (DPO)を活用した、最新抗体デザイン手法 ABDPOを紹介！
DPO を利用した抗体のデザイン手法 ABDPO を紹介します！
Articles 最新タンパク質言語モデル METL の正体
生物物理学的な指標を活用した新しいタンパク質言語モデル (METL) を紹介します！
Articles タンパク質間相互作用の親和性を予測するProAffinity-GNNを紹介
マニュアルでキュレーションした改良データセットを活用して、タンパク質間相互作用の強度を予測するモデルを開発した論文を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】最新アルゴリズムでバインダーデザインを最適化した事例を紹介
Direct Preference Optimization (DPO) を活用して、タンパク質のバインダーデザインを最適化する手法を紹介します！