Articles 【抗体デザイン】ドメイン生成アルゴリズムを活用した抗体活性予測手法を紹介します
ドメイン生成アルゴリズムを利用した、抗体の結合活性予測手法を紹介します！
2024-08
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Articles 【ProteinMPNN】免疫原性の低い配列を設計できる inverse folding モデル、CAPE-MPNN とは
Inverse folding タスクで、MHC-class I 提示可能性の低い配列を設計できるチューニングモデル CAPE-MPNN を紹介します！
Articles 【PLM】タンパク質の変異体予測に、”few-shot fitness prediction” を活用するときのコツ
ランキングベースの損失関数でファインチューニングすることで、タンパク質言語モデルによる変異体予測成績を改善できることを紹介します！
Articles 【デノボバインダー設計】経口投与可能なサイトカインミミックをデノボでデザイン
計算機で IL-23R binder と、IL-17A binder を設計した実施例を紹介します！
Articles 【AlphaFold】柔軟性の高い “disordered”領域の相互作用を解析するコツ
intrinsically disordered region に関する相互作用を、AlphaFold2 を使って解析する手法を紹介します！
Articles 【MLモデル】Saprot : オープンコミュニティで構築された高性能タンパク質基盤モデル
タンパク質の機能予測に汎用的に活用できる深層学習モデル Saprot とその周辺基盤について紹介します！
Articles 【変異探索】タンパク質の活性増強改変を探索する SOTA 手法 “EVOLVEpro” とは
タンパク質言語モデルと Active learning を組み合わせた活性増強改変を探索する手法 EVOLVEpro を紹介します！
Articles 【酵素】基質特異性に重要な構造的特徴をMDシミュレーションで解析
酵素の基質特異性にかかわる構造的特徴を、MDシミュレーションで解析した結果を紹介します！
Articles 【RFDiffusion】非構造化領域に結合するバインダーを RFDiffusion でデザイン
タンパク質の非構造化領域に結合するバインダーを計算機で設計できることを示した論文を紹介します！
Articles 【タンパク質の変異体予測】メタ学習を利用した言語モデルのチューニング手法を紹介！
メタ学習を活用して、タンパク質言語モデルを少量のデータセットで効率的にファインチューニングする手法を紹介します！