2025-02

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【抗体デザイン】Contrastive Preference Optimization (CPO) を活用した大規模言語モデルのファインチューニング手法を紹介

Contrastive Preference Optimization (CPO) を活用してタンパク質言語モデルをファインチューニングし、抗体デザインに適用した事例を紹介します!
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【タンパク質デザイン】柔軟性の高い配列を生成できる ProteinMPNN の改良モデル、Flexpert を紹介!

タンパク質の柔軟性を予測し、柔軟性の高い配列を設計する手法 Flexpert を紹介します!
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【バインダーデザイン】peptide-MHC バインダーにはデノボスキャフォールドがおすすめ

peptide-MHC に対するバインダーをデノボで設計した実施例を紹介します!
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【抗体デザイン】抗原配列のみからデノボでVH/VL配列を生成するバインダーデザイン手法 MAGE を紹介

ウイルス抗原に対して LLM モデルで抗体をデノボ設計する手法 MAGE を紹介します!
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【SURFACE-Bind】バインダーデザインに重要な標的エピトープをヒトタンパク質に対して網羅的に探索

ヒトタンパク質の相互作用界面を網羅的に探索してデータベース化した論文を紹介します!
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【抗体スクリーニング】独メルクから sdAb 取得プラットフォームの紹介

VHH 取得に NGS データに基づく LSTM ベースの配列生成モデルを活用した実施例を紹介します!
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【抗体デザイン】計算機デザインパイプライン EvolveX で Vsig4 VHH バインダーを最適化

抗体の最適化パイプライン EvolveX を紹介します!
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【抗体デザイン】抗体の計算機設計の性能を競うコンペティション AIntibody の紹介

抗体のデザインに特化したコンペティション AIntibody の開催 をリリースしたレポートを紹介します!
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【RFpeptide】RFDiffusion を利用した環状ペプチドデザインで single nM のバインダー取得に成功

RFDiffusion を用いた環状ペプチド設計で、実験的にバインダーを設計できることを証明した論文を紹介します!