Articles 【バインダーデザイン】true binder を選抜する最適な評価指標を探索
デノボタンパク質バインダー設計における「どの設計が実験的に成功するかを予測する指標」を大規模に解析した研究を紹介します！
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Articles 【抗体デザイン】反復的にCDR配列を最適化する抗体設計パイプライン NanoDesigner とは
ナノボディのデノボデザインにおいて、従来の dock and optimize アプローチにEMアルゴリズムを適用し設計と構造予測を反復することで、設計の成功確度を高めた設計パイプライン NanoDesignerを紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】拡散モデル・ハルシネーション型両方のタンパク質設計が可能なパイプライン PXDesign について
エンドツーエンドのタンパク質バインダー設計パイプライン、PXDesign を紹介します！
Articles 【活性予測】ディスプレイライブラリの配列データからKDを予測するモデル ProBound とは
高スループットシーケンスデータからタンパク質–リガンド（特に転写因子とDNA）結合の親和性を、物理的に解釈可能な形で推定する新しい機械学習フレームワーク「ProBound」を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】pLM の確率分布からから直接サンプリングする抗体最適化設計手法 ALLM-Ab とは
アクティブラーニング × 言語モデル微調整による抗体最適化フレームワークである ALLM-Ab を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】pAE を利用した BindCraft の次世代手法を紹介！
タンパク質バインダー設計における既存の「ipTM最適化」の限界を改善するために、構造予測モデル（AlphaFold2-Multimer）の信頼度出力をエネルギーベースモデル（EBM）として再解釈し、新しい最適化指標「pTMEnergy」を提案・検証した研究を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】DPO で最適化されたLigandMPNN で配列成功率を２倍に
タンパク質配列設計における「設計可能性（designability）」を直接最適化する新手法を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】表面の局所形状をもとに抗体の凝集性を予測する方法
モノクローナル抗体（mAb）の凝集率を高精度で予測する新しい in silico 手法についての研究を紹介します！
Articles 【Baker Lab】デノボデザインタンパク質のハイスループットスクリーニングシステム
高速かつ低コストで多数のタンパク質を発現・精製・特性評価する新規プロトコルを紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】RFDiffusion で線形ペプチドのバインダー設計
ポックスウイルスの主要膜タンパク質 F13L を標的に、RFdiffusion を用いて新規ペプチド阻害剤を計算設計した研究です！