Articles 【タンパク質構造解析】CASP15で好成績を収めたDeepFoldを深掘り！
DeepFold という名の新しいタンパク質構造予測モデルについて紹介します！タンパク質の側鎖とバックボーンの精度を高めるために、損失関数とテンプレート機能、エネルギー関数に最適化の工夫がみられます。
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Articles リガンド結合親和性予測のためのアクティブラーニングプロトコルのベンチマーク
アクティブラーニングを利用した低分子リガンドと標的タンパク質の結合親和性予測手法について、その精度をベンチマークした論文を紹介します！
Articles 【タンパク質構造予測】単一配列からのタンパク質構造予測におけるColabFoldの革新
本論文では、ColabFold に標的のタンパク質配列を投げるだけで、タンパク質の代替構造を予測できることを示した論文を紹介します！
Articles AlphaFold2を活用したタンパク質の多様な構造状態の予測
タンパク質の多状態構造を、MSA のクラスタリングと AlphaFold を利用して予測する AF-cluster という手法を紹介します！
Articles 現在の結合親和性予測モデルは、どんな特徴を学習しているのか
結合親和性予測のための既存の機械学習モデルが、どのような特徴量を用いて親和性を予測しているのか、そのメカニズムについて解析した論文を紹介します！
Articles プラスミド構築を完全自動化！
プラスミド構築を自動化するためのプラットフォーム開発についての論文を紹介します！
Articles タンパク質言語モデルの民主化：効率的なパラメータファインチューニング
タンパク質言語モデルに対するパラメータ効率的なファインチューニング手法を紹介します！
Articles Umolによる配列情報からのタンパク質-リガンド複合体の構造予測
Umol は、タンパク質の配列とリガンドを表す SMILES 文字列から、タンパク質-リガンド複合体の全原子構造を予測する AI システムを紹介します！
Articles 多重配列アラインメントを使用しないタンパク質構造予測の新手法
PLM と AlphaFold の手法を活用したタンパク質構造予測モデル HelixFold を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】リガンドペプチドでタンパク質の集積化を誘導
リガンドペプチドの結合によって、タンパク質間の集積化を誘導できるタンパク質のデザイン事例を紹介します！