Articles 【配列デザイン】米国スタートアップ Plofluent Bio がタンパク質言語モデルを用いた配列設計手法 prose LM を公開
タンパク質言語モデルを活用した、タンパク質配列設計手法 proseLM を紹介します！
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Articles 【結合ポケット予測】GCN を利用したリガンド結合サイト予測手法を紹介！
グラフトランスフォーマーニューラルネットワークを活用した、リガンド結合サイトの予測手法を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】自然言語からタンパク質をデザインする方法
自然言語で記述した情報から、その内容を反映したタンパク質配列を生成する手法 Pinal を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】ドメイン生成アルゴリズムを活用した抗体活性予測手法を紹介します
ドメイン生成アルゴリズムを利用した、抗体の結合活性予測手法を紹介します！
Articles 【ProteinMPNN】免疫原性の低い配列を設計できる inverse folding モデル、CAPE-MPNN とは
Inverse folding タスクで、MHC-class I 提示可能性の低い配列を設計できるチューニングモデル CAPE-MPNN を紹介します！
Articles 【PLM】タンパク質の変異体予測に、”few-shot fitness prediction” を活用するときのコツ
ランキングベースの損失関数でファインチューニングすることで、タンパク質言語モデルによる変異体予測成績を改善できることを紹介します！
Articles 【デノボバインダー設計】経口投与可能なサイトカインミミックをデノボでデザイン
計算機で IL-23R binder と、IL-17A binder を設計した実施例を紹介します！
Articles 【AlphaFold】柔軟性の高い “disordered”領域の相互作用を解析するコツ
intrinsically disordered region に関する相互作用を、AlphaFold2 を使って解析する手法を紹介します！
Articles 【MLモデル】Saprot : オープンコミュニティで構築された高性能タンパク質基盤モデル
タンパク質の機能予測に汎用的に活用できる深層学習モデル Saprot とその周辺基盤について紹介します！
Articles 【変異探索】タンパク質の活性増強改変を探索する SOTA 手法 “EVOLVEpro” とは
タンパク質言語モデルと Active learning を組み合わせた活性増強改変を探索する手法 EVOLVEpro を紹介します！