Articles 【PLM】タンパク質の変異体予測に、”few-shot fitness prediction” を活用するときのコツ
ランキングベースの損失関数でファインチューニングすることで、タンパク質言語モデルによる変異体予測成績を改善できることを紹介します！
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Articles 【デノボバインダー設計】経口投与可能なサイトカインミミックをデノボでデザイン
計算機で IL-23R binder と、IL-17A binder を設計した実施例を紹介します！
Articles 【AlphaFold】柔軟性の高い “disordered”領域の相互作用を解析するコツ
intrinsically disordered region に関する相互作用を、AlphaFold2 を使って解析する手法を紹介します！
Articles 【MLモデル】Saprot : オープンコミュニティで構築された高性能タンパク質基盤モデル
タンパク質の機能予測に汎用的に活用できる深層学習モデル Saprot とその周辺基盤について紹介します！
Articles 【変異探索】タンパク質の活性増強改変を探索する SOTA 手法 “EVOLVEpro” とは
タンパク質言語モデルと Active learning を組み合わせた活性増強改変を探索する手法 EVOLVEpro を紹介します！
Articles 【酵素】基質特異性に重要な構造的特徴をMDシミュレーションで解析
酵素の基質特異性にかかわる構造的特徴を、MDシミュレーションで解析した結果を紹介します！
Articles 【RFDiffusion】非構造化領域に結合するバインダーを RFDiffusion でデザイン
タンパク質の非構造化領域に結合するバインダーを計算機で設計できることを示した論文を紹介します！
Articles 【タンパク質の変異体予測】メタ学習を利用した言語モデルのチューニング手法を紹介！
メタ学習を活用して、タンパク質言語モデルを少量のデータセットで効率的にファインチューニングする手法を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】ProteinMPNNとAbLangのアンサンブルモデルで抗体配列をデザイン
逆折り畳みモデルと抗体の言語モデルとのアンサンブルで、抗体の配列設計精度を向上させた論文を紹介します！
Articles 【バイオナノマテリアル】半導体作成に活用できる無機物結合タンパク質を計算機で設計
ZnO (酸化亜鉛) に結合するバイオマテリアルを計算機でデザインした報告を紹介します！