Articles 【抗体DB】機械学習に適した抗体・抗原PPIデータベース NAStructuralDBを紹介！
抗体・ナノボディ・抗原・一般タンパク質複合体を対象に、構造的・相互作用的特徴を網羅的にアノテーションした新しい構造データベース「NAStructuralDB」を紹介します！
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Articles 【抗体】抗体医薬品におけるアミノ酸配列の特徴を網羅的に解析
Thera-SAbDab に登録された抗体情報を参照して、抗体医薬品の CDR におけるアミノ酸配列の特徴を解析したレポートを紹介します！
Articles 【抗体】医療用抗体の情報を一括検索！ YAbS データベースを紹介
抗体医薬品のキュレーションデータベース YAbS を紹介します！
Articles 【SURFACE-Bind】バインダーデザインに重要な標的エピトープをヒトタンパク質に対して網羅的に探索
ヒトタンパク質の相互作用界面を網羅的に探索してデータベース化した論文を紹介します！
Articles 【抗体】特許や学術論文に登録された抗体配列を検索できるデータベース PLAbDab を紹介！
特許や文献から検索できる抗体クローンの情報を格納したデータベース、PLAbDab を紹介します！
Articles 抗ウイルス薬の包括的データベースを機械学習で分析
ウイルスに対するワクチン・抗体・化合物の情報を、vitroの活性から知見情報まで、多面的かつ網羅的に格納したデータベースを紹介します。
Articles 【バイオインフォ】”descriptor” とは
論文タイトル
Recent applications of deep learning and machine intelligence on in silico drug discovery: methods, tools and...
Biotechnology 【Uniprot】蛋白質情報の自動取得
はじめに
Uniprotは蛋白質の配列や機能に関する情報を提供する公共データベースです。あらゆる蛋白質の情報が網羅的に格納されています。
Uniprotから多種類の情報を一括して取得したり、プロジェクト特有な解析を行う場合は、...
Biotechnology 【Human Protein Atlas】ダウンロードできるデータの全貌
前回は、Human Protein Atlas の概要について解説しました。
今回は、データベースからダウンロードできるデータ構造について紹介します。
下のページから zip ファイルをダウンロードすることができま...
Biotechnology 【Human Protein Atlas】概要の紹介
Human Protein Atlas とは
Human Protein Atlas とは、ヒトを中心に様々な器官、組織、細胞ごとに分類されたタンパク質の、発現や局在に関するデータベースです。
2003年からスウェ...