design

Articles

【抗体最適化】変異体の DDG を構造モデルなしで予測できる Light-DDG を紹介

抗体の変異体のΔΔGをインシリコで予測する Light-DDG を紹介します!
Articles

【タンパク質生成モデル】最新の生成モデルフレームワーク Bayesian Flow Networks を活用したタンパク質生成手法を紹介!

Bayesian Flow Networks を活用したタンパク質配列生成モデル ProtBFN を紹介します!
Articles

【酵素デザイン】酵素の設計を可能にするRFdiffusion の新バージョン RFdiffusion2 を紹介

原子レベルの生成を可能にする酵素設計に適したモデル RFdiffusion2 を紹介します!
Articles

【タンパク質デザイン】HDX-MSデータを活用したMLモデルで、局所的な揺らぎを制御するタンパク質を設計

多数のタンパク質ドメインに対し、HDX-MSで高エネルギー状態の挙動を測定する方法を開発し、安定性や協同性を制御する配列を設計した事例を紹介します!
Articles

【タンパク質デザイン】13種のタンパク質生成モデルの性能を比較検証してみた

タンパク質の構造・配列生成モデルの性能や特徴を同一試験上で比較評価した論文を紹介します!
Articles

【バインダーデザイン】GPCR に対するバインダーをデノボデザインした事例を紹介!

GPCR に対するアゴニスト・アンタゴニストバインダーをデノボデザインした実施例を紹介します!
Articles

【抗体デザイン】ProteinMPNN で既存の抗体を intrabody 化できます

既存の抗体を intrabody として機能する分子に変換するための in silico フレームワークデザイン手法を紹介します!
Articles

【デノボデザイン】RFDiffusion と ChemNet を利用した酵素のデノボデザイン事例を紹介!

セリン加水分解酵素をデノボデザインした実施例を紹介します!
Articles

【抗体デザイン】Flow Matching を活用した抗体バインダーの設計手法 FlowDesign を紹介!

Flow Matching を利用した抗体のデザイン手法 FlowDesign を紹介します!
Articles

【ワクチンデザイン】インフルエンザの bnAbs を誘導できるワクチンを計算機で設計

インフルエンザワクチンのタンパク質デザインを紹介します!