Articles 【バインダーデザイン】true binder を選抜する最適な評価指標を探索
デノボタンパク質バインダー設計における「どの設計が実験的に成功するかを予測する指標」を大規模に解析した研究を紹介します！
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Articles 【抗体デザイン】反復的にCDR配列を最適化する抗体設計パイプライン NanoDesigner とは
ナノボディのデノボデザインにおいて、従来の dock and optimize アプローチにEMアルゴリズムを適用し設計と構造予測を反復することで、設計の成功確度を高めた設計パイプライン NanoDesignerを紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】拡散モデル・ハルシネーション型両方のタンパク質設計が可能なパイプライン PXDesign について
エンドツーエンドのタンパク質バインダー設計パイプライン、PXDesign を紹介します！
Uncategorized 【タンパク質デザイン】Institute for Protein Design で活用されているデータフレームワーク AtomWorks を紹介
AtomWorks という高品質なデータ処理とモジュール化されたフレームワークを通じて基盤モデル開発を加速することを目指した研究を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】表面の局所形状をもとに抗体の凝集性を予測する方法
モノクローナル抗体（mAb）の凝集率を高精度で予測する新しい in silico 手法についての研究を紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】RFDiffusion で線形ペプチドのバインダー設計
ポックスウイルスの主要膜タンパク質 F13L を標的に、RFdiffusion を用いて新規ペプチド阻害剤を計算設計した研究です！
Articles 【AIエージェント】SARS-CoV-2バインダーを自動で設計する AI エージェントシステムを紹介
大規模言語モデル（LLM）を用いた多エージェントAIシステム「Virtual Lab」により、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規ナノボディ（抗体）の設計と実験検証を実現した実施例を紹介します！
Uncategorized 【バインダーデザイン】EvoBind で GPCR アゴニストを設計した事例を紹介
構造情報を一切使わず、配列情報のみからGタンパク質共役受容体（GPCR）に作用する環状ペプチドアゴニストを設計する初の成功例を紹介します！
Articles 【構造予測】フォールドスイッチタンパク質のデザイン
AlphaFold2（AF2）を使ってタンパク質の異なる構造状態（とくにフォールドスイッチ）を予測し、それを安定化させるための変異を設計する手法を紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】非天然アミノ酸を有するペプチドバインダーを設計できる EvoBindRare を紹介！
非天然アミノ酸（noncanonical amino acids, NCAAs）を含むタンパク質の構造予測とデザインを目的とした深層学習モデル「RareFold」を紹介します！