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【タンパク質デザイン】プロテアーゼの基質配列を予測・生成するパイプライン CleaveNet を紹介

深層学習を用いてプロテアーゼ基質(特定のプロテアーゼによって切断されるペプチド)の設計を行う新しい AI パイプライン「CleaveNet」を提案・検証した研究です!
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【抗体デザイン】pH 依存的に FcRn に結合するモノマー型 Fc のデザイン

モノマー型 Fc(mFc)を用いた新しい抗体・融合タンパク質設計のための構造工学研究を紹介します!
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【抗体デザイン】AbLang を活用して ProteinMPNN の配列設計性能を改善

抗体言語モデルである AbLang の出力スコアを加味することで、ProteinMPNN の抗体配列設計性能を改善した報告を紹介します!
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【抗体デザイン】sdAb のフレームワークに新規機能を付与する生成モデル TFDesign とは

拡散モデルベースの抗体に新規機能を付与する設計手法 TFDesign-sdAb を提案し、sdAb にProteinA 結合性を付与した応用例を紹介します!
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【バインダーデザイン】Boltz-1を活用した新規デノボバインダーデザイン手法を紹介

全原子予測モデルを活用したバインダー設計手法 Boltzdesign1を紹介します!
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【タンパク質デザイン】Adaptyv Bio のバインダーデザインコンペ結果報告

タンパク質のデザインコンペの結果報告を紹介します!
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【抗体最適化】 Prescient Design の拡散モデルベースの抗体最適化手法 LaMBO-2 について解説

Discrete Diffusion Model を活用した抗体最適化手法 LaMBO-2 を紹介します!
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【抗体配列生成】Prescient Design の抗体配列生成手法 dWJS を紹介

望みの性質をもつタンパク質配列を効率的にサンプリングする手法、Discrete Walk-Jump Sampling (dWJS)を紹介します!
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【抗体最適化】変異体の DDG を構造モデルなしで予測できる Light-DDG を紹介

抗体の変異体のΔΔGをインシリコで予測する Light-DDG を紹介します!
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【タンパク質生成モデル】最新の生成モデルフレームワーク Bayesian Flow Networks を活用したタンパク質生成手法を紹介!

Bayesian Flow Networks を活用したタンパク質配列生成モデル ProtBFN を紹介します!