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【バインダーデザイン】RFDiffusion で線形ペプチドのバインダー設計

ポックスウイルスの主要膜タンパク質 F13L を標的に、RFdiffusion を用いて新規ペプチド阻害剤を計算設計した研究です!
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【バインダーデザイン】EvoBind で GPCR アゴニストを設計した事例を紹介

構造情報を一切使わず、配列情報のみからGタンパク質共役受容体(GPCR)に作用する環状ペプチドアゴニストを設計する初の成功例を紹介します!
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【バインダーデザイン】構造いらずのペプチドバインダーデザイン手法 PepPrCLIP とは

従来の構造依存的なアプローチを必要とせずに、配列情報のみから新規ペプチド結合分子(binder)を設計するためのフレームワーク「PepPrCLIP」を紹介します!
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【ペプチドバインダーデザイン】拡散モデルを活用した多目的最適なペプチドバインダーの設計手法 PepTune とは

ペプチドバインダーのデノボデザイン手法 PepTune を紹介します!
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【タンパク質デザイン】GPT と ESM モデルを同時に訓練した生成モデルで抗菌ペプチドをデザイン

抗菌ペプチドやデヒドロゲナーゼなどの機能を持つタンパク質を生成するモデルを、GPT モデルのファインチューニングで構築した研究成果を示した論文を紹介します!
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【ペプチド】ペプチド関連のin silicoツールを網羅してみた

ペプチドに特化して、データベース、構造予測、デザインに関わるin silicoツールについて紹介します。