Articles 【バインダーデザイン】true binder を選抜する最適な評価指標を探索
デノボタンパク質バインダー設計における「どの設計が実験的に成功するかを予測する指標」を大規模に解析した研究を紹介します！
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Articles 【タンパク質デザイン】拡散モデル・ハルシネーション型両方のタンパク質設計が可能なパイプライン PXDesign について
エンドツーエンドのタンパク質バインダー設計パイプライン、PXDesign を紹介します！
Articles 【AIエージェント】SARS-CoV-2バインダーを自動で設計する AI エージェントシステムを紹介
大規模言語モデル（LLM）を用いた多エージェントAIシステム「Virtual Lab」により、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規ナノボディ（抗体）の設計と実験検証を実現した実施例を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】AF3 から RFDiffusion まで HPC で扱えるコンテナを紹介
AlphaFold3 や RFdiffusion などの実用化を目的とした、コンテナ化とマルチモデル統合プラットフォーム（OmniFold）の開発について解説します！
Articles 【構造予測】フォールドスイッチタンパク質のデザイン
AlphaFold2（AF2）を使ってタンパク質の異なる構造状態（とくにフォールドスイッチ）を予測し、それを安定化させるための変異を設計する手法を紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】非天然アミノ酸を有するペプチドバインダーを設計できる EvoBindRare を紹介！
非天然アミノ酸（noncanonical amino acids, NCAAs）を含むタンパク質の構造予測とデザインを目的とした深層学習モデル「RareFold」を紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】任意のフォールドをもつタンパク質バインダーを設計できる FoldCraft を紹介
特定の構造フォールド（折りたたみ様式）を持つタンパク質結合分子（バインダー）をディープラーニングで設計する新しい手法「FoldCraft」を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】拡散モデルを活用した最新 inverse folding model, “MapDiff” を紹介
逆タンパク質フォールディング（Inverse Protein Folding, IPF）を目的とする新しい生成モデルを紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】立体構造を変化させる変異を予測する手法 “ConformationalBiasing” とは
タンパク質の立体構造の平衡を意図的にシフトさせる変異を、計算的に効率よく設計する手法を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】抗原親和性予測のための既存のMLモデルは汎化性能に乏しい
抗体の1残基変異データベース AbDesign の構築と、既存の機械学習予測モデルの限界を明らかにした研究を紹介します！