Articles ProtBFFによるタンパク質間結合ΔΔG予測の改善
本論文では、タンパク質間結合自由エネルギー変化（ΔΔG）予測において、既存データセットの問題点を明らかにし、生物物理的特徴を明示的に取り入れる新しい枠組み「ProtBFF」を紹介します！
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Articles 【タンパク質デザイン】T-cell engager の分子形もインシリコで最適化
高スループット機能アッセイと多目的ベイズ最適化を閉ループ統合し、抗原密度依存 avidity を設計原理として HER2×CD3 TCE の完全選択的活性を実現した論文を紹介します！
Articles 【タンパク質構造予測】モデルの性能を評価するためのベンチマーク FoldBench と各モデルの性能比較結果
all-atom 構造予測モデルを、公平かつ低ホモロジー条件で横断評価するベンチマーク「FoldBench」 と、ベンチマーク結果について紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】PLM や Diffusion モデルを「ガイド」する方法を総まとめ
生成AI（GMPDs: Generative Models for Protein Design）を「望む性質をもつタンパク質を作る方向にコントロールする方法」を体系的に整理したレビューを紹介します！
Articles 【抗体デザイン】Baker 研から pMHC に対する抗体バインダー設計手法が公開
pMHC（peptide–MHC）を標的とする TCR と抗体を計算設計するための新しいフレームワーク ADAPT を紹介します！
Articles 【AI学習】初心者でも学べるAIタンパク質設計手法の教育用ノートブック DL4Proteins とは
AI×タンパク質設計の最先端ツール（RFDiffusion・ProteinMPNN・AlphaFold2 など）を誰でも学べるよう体系化した「教育用ノートブック（10本）」を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】Multi-Step Diffusion による Hallucination デザイン手法 Protein Hunter とは
構造予測モデルのハルシネーション能力を逆利用して、構造と配列を同時に最適化する新しい protein design フレームワーク、Protein Hunter を紹介します！
Articles 【Synthekine】デノボデザインで人工サイトカインを創成した研究を紹介
de novoタンパク質設計を用いて人工サイトカイン様分子（Novokines）を大量生成し、その免疫シグナル活性を網羅的にマッピングした研究を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】リン酸化ペプチドバインダーを設計できる RFDの拡張版 RFD2-MI とは
RFDiffusion2を拡張してリン酸化依存的タンパク質結合分子を設計可能にした研究を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】Baker研から汎用的なpH依存性バインダーの設計手法が公開
pHに応答して結合力が変化するタンパク質バインダーを、計算設計によって創出する方法を初めて体系化した研究を紹介します！