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【タンパク質デザイン】PLM や Diffusion モデルを「ガイド」する方法を総まとめ

生成AI(GMPDs: Generative Models for Protein Design)を「望む性質をもつタンパク質を作る方向にコントロールする方法」を体系的に整理したレビューを紹介します!
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【抗体デザイン】Baker 研から pMHC に対する抗体バインダー設計手法が公開

pMHC(peptide–MHC)を標的とする TCR と抗体を計算設計するための新しいフレームワーク ADAPT を紹介します!
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【AI学習】初心者でも学べるAIタンパク質設計手法の教育用ノートブック DL4Proteins とは

AI×タンパク質設計の最先端ツール(RFDiffusion・ProteinMPNN・AlphaFold2 など)を誰でも学べるよう体系化した「教育用ノートブック(10本)」を紹介します!
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【タンパク質デザイン】Multi-Step Diffusion による Hallucination デザイン手法 Protein Hunter とは

構造予測モデルのハルシネーション能力を逆利用して、構造と配列を同時に最適化する新しい protein design フレームワーク、Protein Hunter を紹介します!
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【Synthekine】デノボデザインで人工サイトカインを創成した研究を紹介

de novoタンパク質設計を用いて人工サイトカイン様分子(Novokines)を大量生成し、その免疫シグナル活性を網羅的にマッピングした研究を紹介します!
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【タンパク質デザイン】リン酸化ペプチドバインダーを設計できる RFDの拡張版 RFD2-MI とは

RFDiffusion2を拡張してリン酸化依存的タンパク質結合分子を設計可能にした研究を紹介します!
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【タンパク質デザイン】Baker研から汎用的なpH依存性バインダーの設計手法が公開

pHに応答して結合力が変化するタンパク質バインダーを、計算設計によって創出する方法を初めて体系化した研究を紹介します!
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【バインダーデザイン】HPC で効率的にタンパク質を設計できるデザインパイプライン ProteinDJ を紹介

高性能計算環境(HPC)上で効率的に動作する新しいタンパク質設計パイプライン「ProteinDJ」を紹介します!
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【タンパク質デザイン】GPUクラスタで並列計算ができるバインダーデザインパイプライン BinderFlow とは

バインダーを効率的に設計するための、自動化・並列化されたパイプライン「BinderFlow」を紹介します!
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【RFdiffusion】全原子生成モデル RFdiffusion3 の威力を紹介!

これまでのRFdiffusion系列を発展させた全原子レベルのタンパク質設計モデル RFD3 を紹介します!