RFdiffusion

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【RFpeptide】RFDiffusion を利用した環状ペプチドデザインで single nM のバインダー取得に成功

RFDiffusion を用いた環状ペプチド設計で、実験的にバインダーを設計できることを証明した論文を紹介します!
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【ペプチドデザイン】環状ペプチドを RFDiffusion で設計する方法

RFDiffusion を利用した環状ペプチド設計手法を紹介します!
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【抗原デザイン】GPCRの熱安定化+分子量増大のためのデノボスキャフォールドデザイン

対象の GPCR をクライオ電子顕微鏡で構造解析するための、熱安定化かつ分子量増大を目的としたタンパク質エンジニアリング手法を紹介します!
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【RFDiffusion】Baker 研から極性かつβストランドエピトープに対する新規バインダーデザイン手法を発表

Baker 研から β ストランドエピトープに対するバインダーデザインの手法を紹介します!
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【バインダーデザイン】Baker 研からインスリンアゴニストのデノボデザイン事例が公開

計算機でインスリンアゴニストを設計した事例を紹介します!
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【バインダーデザイン】広く極性に偏った標的エピトープに結合するバインダーを RFDiffusion で生成するには

TNFR に対するバインダーデザインを事例に、広い結合界面を標的としたバインダーデザインの成功率を高める工夫を紹介します!
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【RFDiffusion】非構造化領域に結合するバインダーを RFDiffusion でデザイン

タンパク質の非構造化領域に結合するバインダーを計算機で設計できることを示した論文を紹介します!
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【抗体デザイン】RFDiffusionを利用した抗体デザイン事例がついに現る

ファインチューニングされたRFDiffusionで、抗原結合VHHをデザインした事例を紹介します!
Biotechnology

【RFDiffusion】バインダーデザインにおけるAF2スクリーニングのコツ

RFDiffusionでバインダーデザインするときのコツを紹介します!
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【RFDiffusion】低分子に対するタンパク質バインダーを計算機で生成して構造予測!

複合体の構造予測やデザインを、非タンパク質性の分子にまで拡張した計算機手法、RoseTTAFold-All-Atom (RFAA) と RFdiffusion All-Atom (RFdiffusionAA) について解説した論文を紹介します!