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【Rosetta】柔軟に骨格構造にモチーフを移植できるプロトコル、”Fold From Loops”とは

Rosettaで、特定のエピトープ構造をスキャフォールドにグラフトするプロトコル、"Fold From Loops" (FFL)について紹介します。
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【Rosetta】結合モチーフをグラフティングする手法、”MotifGraft mover”を解説

標的タンパク質に対して結合するバインダーペプチドを、スキャフォールドへグラフティングする"MotifGraft mover"について、解説します。
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【Rosetta】テキストファイルひとつでデザインできる!RosettaRemodelというインターフェースについて

Rosettaに実装された、タンパク質をデザインするための統一インターフェースである、RosettaRemodelについて紹介します。
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【Rosetta】Rosettaに実装されているプロトコルを総まとめ!

Rosettaに実装されたツールを目的ごとにまとめたレビュー論文を紹介します。
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【Rosetta】エネルギー関数をdualOptEで最適化

Rosettaで利用されるデフォルトのエネルギー関数(REF2015)の予測精度を評価した論文を紹介します。
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Rosettaを用いたデノボタンパク質デザイン手法をレビュー

タンパク質のデノボデザインに有用な計算手法について概説されたレビュー論文を紹介します。
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Rosettaのエネルギー関数まとめ

Rosettaで使用されるエネルギー関数において参照される、各エネルギー項の算出式を主に解説した論文を紹介します。
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【量子コンピュータ】Rosettaの機能を量子コンピュータで実現 QPackerとは

量子アルゴリズムでRosetta Packerの手法を実現させた、QPackerについて紹介します。
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【Rosetta】PyRosettaとJupyter Notebookを活用したRosetta学習ツールの紹介

PyRosettaとJupyter Notebookを活用して、Rosettaの利用方法を学べるツールを紹介します。
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【Rosetta】Pythonで扱えるRosetta分子モデリングツールの解説

RosettaパッケージをPythonベースで実装した、PyRosettaについて解説した論文を紹介します。