Articles 【配列デザイン】米国スタートアップ Plofluent Bio がタンパク質言語モデルを用いた配列設計手法 prose LM を公開
タンパク質言語モデルを活用した、タンパク質配列設計手法 proseLM を紹介します！
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Articles 【タンパク質デザイン】自然言語からタンパク質をデザインする方法
自然言語で記述した情報から、その内容を反映したタンパク質配列を生成する手法 Pinal を紹介します！
Articles 各種配列設計手法を徹底比較！（２）
大規模なベンチマークデータを用いて、配列デザイン手法の性能を比較した論文を紹介します！
Articles 【配列デザイン】各種配列設計手法を徹底比較！
配列デザイン手法の性能をベンチマークした論文を紹介します！
Biotechnology 【Uniprot】蛋白質情報の自動取得
はじめに
Uniprotは蛋白質の配列や機能に関する情報を提供する公共データベースです。あらゆる蛋白質の情報が網羅的に格納されています。
Uniprotから多種類の情報を一括して取得したり、プロジェクト特有な解析を行う場合は、...
Biotechnology アミノ酸配列の分散表現
近年の機械学習の発展に伴い、蛋白質工学においても機械学習の活用事例が増えています。最適なアミノ酸配列の提案や、配列集団のクラスタリングをおこなうために、機械学習の訓練データにアミノ酸配列を利用する際には、一文字表記の列挙文字列を数値ベクト...
Biotechnology 抗体配列構造解析ツール(ANARCI)の使い方
ANARCIの使用法について説明します。