Articles 【ペプチド】ペプチド関連のin silicoツールを網羅してみた
ペプチドに特化して、データベース、構造予測、デザインに関わるin silicoツールについて紹介します。
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Articles Articles 【de novo design】タンパク質の主鎖原子構造に着目した「van der Mer」を利用して、低分子に結合するタンパク質をデザイン
タンパク質の主鎖原子構造に着目した「van der Mer」を利用して、「低分子」に結合するタンパク質をde novoデザインした論文を紹介します。
Articles 【de novo design】TERMを組み合わせてバインダーをデザインする方法
「tertiary motifs(TERM)」を組み合わせることで、標的タンパク質に結合する分子をin silicoでデザインする手法を紹介します。
Articles 【AlphaFold】複合体構造予測手法を利用して、複数のバインダーから高親和性の分子を同定
AlphaFoldを利用して、分子の競合的な結合の確認や、競合分子同士の親和性比較ができることを示した論文を紹介します。
Articles 【de novo design】またしてもタンパク質デザインのレビューを読み解く②
タンパク質のin silico構造予測・デザイン手法をまとめた総説を紹介します。この記事では、デザインを中心に解説します。
Articles 【de novo design】またしてもタンパク質デザインのレビューを読み解く①
タンパク質のin silico構造予測・デザイン手法をまとめた総説を紹介します。この記事では、構造予測を中心に解説します。
Articles 【de novo design】結合分子をin silicoデザインする手法まとめ
標的タンパク質に結合するタンパク質をデザインする手法をまとめた総説を紹介します。
Articles 【de novo design】DeepDreamのパターン検出・生成技術を活用して、タンパク質にも「幻覚」を。
DeepDreamで適応された「hallucination」を活用して、タンパク質をde novoデザインした報告です。
Articles 【AlphaFold】De novo binder designも可能!? AlphaFold応用事例紹介
AlphaFoldを用いたタンパク質デザイン事例について紹介します。
Articles 【AlphaFold】深層学習によるタンパク質構造予測手法を利用した分子デザイン
AlphaFoldを利用したタンパク質デザイン手法について紹介します。