Articles 【de novo design】TERMを組み合わせてバインダーをデザインする方法
「tertiary motifs(TERM)」を組み合わせることで、標的タンパク質に結合する分子をin silicoでデザインする手法を紹介します。
structure
Articles Articles 【AlphaFold】複合体構造予測手法を利用して、複数のバインダーから高親和性の分子を同定
AlphaFoldを利用して、分子の競合的な結合の確認や、競合分子同士の親和性比較ができることを示した論文を紹介します。
Articles 【de novo design】またしてもタンパク質デザインのレビューを読み解く②
タンパク質のin silico構造予測・デザイン手法をまとめた総説を紹介します。この記事では、デザインを中心に解説します。
Articles 【de novo design】またしてもタンパク質デザインのレビューを読み解く①
タンパク質のin silico構造予測・デザイン手法をまとめた総説を紹介します。この記事では、構造予測を中心に解説します。
Articles 【de novo design】結合分子をin silicoデザインする手法まとめ
標的タンパク質に結合するタンパク質をデザインする手法をまとめた総説を紹介します。
Articles 【de novo design】DeepDreamのパターン検出・生成技術を活用して、タンパク質にも「幻覚」を。
DeepDreamで適応された「hallucination」を活用して、タンパク質をde novoデザインした報告です。
Articles 【AlphaFold】De novo binder designも可能!? AlphaFold応用事例紹介
AlphaFoldを用いたタンパク質デザイン事例について紹介します。
Articles 【AlphaFold】深層学習によるタンパク質構造予測手法を利用した分子デザイン
AlphaFoldを利用したタンパク質デザイン手法について紹介します。
Articles 【Rosetta】エネルギーランドスケープの重要性と、trRosettaの威力
trRosettaによるタンパク質デザイン手法が、大域的なエネルギーランドスケープに対して最適な構造を提案する能力があることを示した論文を紹介します。
Articles 【Rosetta】深層学習構造予測モデルtrRosettaの実態
タンパク質構造予測手法のひとつであるtrRosettaと、予測における残基間配向の重要性について紹介します。