Articles 【抗体】新しい深層生成モデルでH3配列をサンプリング
multi-segment preserving samplingという深層生成モデルを提案して、抗体のH3デザインに応用した論文です。
2023-01
Articles Articles 【AlphaFold】バインダーデザインの精度を向上させるAF2とProteinMPNNの役割
AF2やProteinMPNNを使うことで、バインダーのデザイン精度を向上させることができることを実証しています。
Articles 【BERT】SAR2-CoV-2 binderを深層学習で予測！AlphaSeqデータを用いたモデル学習
SAR2-CoV-2 binderを予測する深層学習モデルについて紹介します。
Articles 【抗体デザイン】BERTとGNNを組み合わせた抗体のデザイン手法、AbBERT-HMPNとは
BERTとHMPNを接続して抗体のH3をデザインする手法、AbBERT-HMPNを紹介した論文を紹介します。
Articles 【Pre-taining Language Model】抗体の事前学習言語モデルを総括！
抗体に特化した既知の自然言語事前学習モデル（Pre-trained Antibody Language Models, PALM) についてベンチマークし、一般的なタンパク質を訓練データとする事前学習モデル (Pre-trained Protein Language Models, PPLM) との違いについて考察した論文を紹介します。