Articles 【抗体言語モデル】構造情報を取り入れた抗体の言語モデルAbMAPでAF2越え
抗体構造情報を活用して、タンパク質言語モデルを転移学習させたモデル、AbMAP を紹介します！
2023-06
Articles Articles 【抗原デザイン】複数回膜貫通タンパク質を可溶型タンパク質としてデザイン、ツール分子のデザインに革命
天然の不溶性のタンパク質を、可溶性のタンパク質として発現できるように、配列を設計し直すための手法を紹介します！
3D model 【タンパク質構造予測】AF2全盛期における複合体予測手法の将来展望は
AF2前後のタンパク質複合体構造予測手法をまとめたレビュー論文を紹介します！
Articles 【総説】タンパク質複合体構造予測の現在地
タンパク質の複合体構造を予測する手法の課題について整理したレビュー論文を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】２次構造間に形成されるループの基本原則
タンパク質の２次構造間の配向や、間のループ構造の規則性について言及した論文を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】構造情報が与えられた言語モデルを用いて、タンパク質デザイン
言語モデルにタンパク質の構造情報を与えることで、タンパク質デザイン（配列設計）に応用できるモデル（LMDesign）について解説します！
Articles 【合成生物学】デノボデザインタンパク質によるロジックゲートの開発
Cage/Keyシステムを利用して、2重抗原陽性細胞を検出するシステム、Co-LOCKR を紹介します！
Articles 【デノボデザイン】バイオセンサータンパク質をデノボデザイン
デノボデザインで、任意のリガンドで活性をON/OFFできるバイオセンサーの開発した報告を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】分子最適化にも応用できるタンパク質バインダーデザイン手法EvoProとは
AF2とProteinMPNNの反復実行でタンパク質性のバインダーを生成するパイプラインEvoProについて紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】強化学習でタンパク質をトップダウン的にデザインする Science 論文
強化学習を用いて、タンパク質を、その全体構造を規定してトップダウン的に設計する手法を紹介します。