Articles 【抗体】抗体の抗原結合親和性を予測する深層学習モデル DG-Affinity とは。
抗体の抗原結合親和性を予測する深層学習モデル DG-Affinity を紹介します！
2024-02
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Articles 【抗体デザイン】AB-Bind：抗体の変異体を解析したデータベースを紹介！
32種類の抗原抗体複合体、1101個の変異体のデータが格納されたデータベースである AB-Bind を利用して、抗体の変異デザインと活性の関係性について考察した論文を紹介します！
Articles 【配列デザイン】超高速に配列デザイン可能な PiFoldを紹介！
タンパク質の新規配列デザイン手法 PiFold について解説します！
Articles 【配列デザイン】低分子結合まで応用範囲を拡大！ LigandMPNN とは
低分子リガンドに結合するタンパク質の配列設計ができる深層学習モデル、LigandMPNN について紹介します！
Articles AIベースのドッキング手法は、物理的に妥当なポーズの生成や新規配列への一般化が難しいかも？
物理・化学的な指標をもとに既存のドッキング予測手法をベンチマークするための評価パッケージ PoseBusters について紹介します！
Articles デノボタンパク質デザインにより、ナノポアタンパク質のサイズと形状を自由自在に
新規プロテインデザインを使用して、特定のサイズと形状を持つ伝導性ナノポアを創出した研究を紹介します！
Articles 【FragFold】AlphaFoldを使用した阻害タンパク質断片の高速計算手法を開発！
AlphaFold を用いてタンパク質断片がターゲットタンパク質に結合・阻害するかどうかを予測する新しい方法、FragFold について紹介します！
Articles リガンド結合部位を予測する DeepProSite について解説します！
タンパク質のリガンド結合部位を予測する手法 DeepProSite について紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】構造配列プロファイルを活用した配列設計の新規手法 SPDesign とは
逆折り畳み問題を解く新規手法である SPDesign を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】抗体に特化した配列設計モデル AbMPNN の実態
抗体に特化した逆折り畳み問題を解くモデル、AbMPNN を紹介します！