2026-02

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【タンパク質デザイン】PROTACのデノボデザイン事例を紹介

de novo 設計した小型タンパク質を タンパク質版 PROTAC として使い、BCL-xL を細胞内で分解し、アポトーシスを誘導できることを実証した論文を紹介します!
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【抗体デザイン】Sparse Autoencoder (SAE) を利用して抗体 LLM の理解を深める

抗体言語モデル(p-IgGen)の内部表現を Sparse Autoencoder(SAE)で分解することで、「解釈できる特徴」と「生成を実際に制御できる特徴」は別物であることを示した論文を紹介します!
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【抗体デザイン】抗体特化のPLMは、その他のモデルと何が違うのか

Protein Language Model(PLM)の「アーキテクチャや事前学習の違い」が、抗体特異的な生物学的特徴(CDR、V遺伝子、SHMなど)をどのようなバイアスとして学習させているのか?という問いに答える検証結果を紹介します!
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【抗体デザイン】Latent Labs から最新のデノボデザインモデル Latent-X2が公開

Latent-X2 という all-atom 生成モデル を用いて、抗体とマクロ環状ペプチドをゼロショットで設計し、実験的に実証した報告を紹介します!
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【抗体デザイン】Diffuse Bio から AI設計バインダーをスクリーニングする基盤 RamaX を発表

次世代AI駆動タンパク質設計のための超高スループット実験基盤、RamaXを紹介します!
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【Boltz】Boltz-2の親和性予測器をタンパク質間相互作用に拡張

構造ベース最先端モデル Boltz-2 を PPI 親和性回帰に適用した論文を紹介します!
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【タンパク質構造予測】モデルの性能を評価するためのベンチマーク FoldBench と各モデルの性能比較結果

all-atom 構造予測モデルを、公平かつ低ホモロジー条件で横断評価するベンチマーク「FoldBench」 と、ベンチマーク結果について紹介します!
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【抗体デザイン】抗原・抗体結合に関わる最大規模のデータベースASDについて

抗体–抗原相互作用データを110万件規模で統合し、抗体ML研究を可能にする包括的リファレンスDBを紹介します!
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【タンパク質デザイン】PLM や Diffusion モデルを「ガイド」する方法を総まとめ

生成AI(GMPDs: Generative Models for Protein Design)を「望む性質をもつタンパク質を作る方向にコントロールする方法」を体系的に整理したレビューを紹介します!