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【抗体構造予測】AF2 と言語モデルを融合! H3-OPTの構造予測成績を紹介

抗体のH3構造予測の新手法 H3-OPT について報告した論文です。
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【タンパク質デザイン】環状ペプチドのデザインも AfDesign で。

AfDesign を利用して、標的抗原に結合する環状ペプチドをデザインした論文を紹介します!
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【クライオ電顕】AF2 を利用して電子密度マップからの構造予測精度を向上!

電子密度マップからの構造推定手法 DeepTracer にAF2予測情報を取り入れて、解析精度を向上を試みた研究を紹介します!
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【タンパク質デザイン】新しいタンパク質デザイン手法、 CPDiffusion とは

タンパク質に適用できる拡散生成モデル CPDiffusion について紹介します!
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【抗体デザイン】GearBind で高親和性抗体の改変探索

インシリコで抗体の親和性を増強する改変を予測するモデル GearBind を紹介します!
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【レビュー】機械学習とタンパク質工学。

タンパク質工学に機械学習を用いる価値について、レビューした総説を紹介します!
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【レビュー】機械学習とタンパク質工学。

タンパク質工学に機械学習を用いる価値について、レビューした総説を紹介します!
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【AF2】ドメイン-モチーフインターフェースは、AF2-multimer で予測できる?

AF2 を用いた結合界面構造の予測の妥当性や限界について紹介します!
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【リン酸化サイト同定】深層学習モデルでリン酸化配列を同定する方法

タンパク質のリン酸化サイトを同定するための深層学習モデルについて紹介します!
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【相互作用予測】リガンド結合予測に、タンパク質の構造情報は必要?

深層学習を用いた、タンパク質・低分子リガンド間の相互作用強度予測モデルが、どのような特徴量を捉えて予測しているのか、検証した論文を紹介します!