Articles 【AlphaFold】AF2が示す新しい相互作用様式、その名も”Ghost interactions”
AlphaFold2 (AF2) を利用して、動きが多い領域でのタンパク質とリガンド（小分子）との相互作用、いわゆる"幽霊相互作用"を明らかにした論文を、紹介します。
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Articles Articles 【AlphaFold2】AF2をリガンド結合サイト予測に利用 AF2BINDの実態
AlphaFold2（AF2）のペア表現を利用して、新しいモデルAF2BINDを訓練し、ターゲットとなるタンパク質だけを与えられた場合に、小分子の結合部位を正確に予測する手法を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】酵素の活性予測における生成系AIの活用実績をレビュー
酵素タンパク質のエンジニアリングにおける、生成系AIの活用実績についてレビューした論文を紹介します！
Articles 【RFDiffusion】低分子に対するタンパク質バインダーを計算機で生成して構造予測！
複合体の構造予測やデザインを、非タンパク質性の分子にまで拡張した計算機手法、RoseTTAFold-All-Atom (RFAA) と RFdiffusion All-Atom (RFdiffusionAA) について解説した論文を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】多様な Ig ドメインライブラリを計算機で生成してみたところ・・・
安定で構造多様性のある、イムノグロブリンスキャフォールドライブラリを計算機でデザインした論文を紹介します！
Articles 【ProteinMPNN】配列再設計でタンパク質の発現量を改善するコツ
ProteinMPNN を利用した配列再設計で、天然タンパク質の機能や熱安定性、発現量を改善した実施例を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】タンパク質設計のためのコンペティションがついに開催！
タンパク質デザインのコンペティション開催の概要を紹介します！
Articles 【タンパク質構造解析】トポロジー情報で、タンパク質をエンベディング
タンパク質の特徴を、トポロジカルな構造情報から説明したレポートを紹介します！
Articles 【抗体デザイン】拡散モデルを用いた “State-of-the-art” のデザイン手法を紹介します！
抗体の配列設計手法 AbDesignと、抗原ドッキング手法 AbDock を用いて、抗体の構造予測や抗原親和性増強をおこなう手法を紹介します！
Articles 【AlphaFold】条件付き構造予測で、タンパク質の多状態構造をモデリング
AlphaFold によるタンパク質構造予測を、条件付きで実行する手法 AFEX について紹介します！