Articles 【タンパク質デザイン】２次構造間に形成されるループの基本原則
タンパク質の２次構造間の配向や、間のループ構造の規則性について言及した論文を紹介します！
biospace
Articles Articles 【タンパク質デザイン】構造情報が与えられた言語モデルを用いて、タンパク質デザイン
言語モデルにタンパク質の構造情報を与えることで、タンパク質デザイン（配列設計）に応用できるモデル（LMDesign）について解説します！
Articles 【合成生物学】デノボデザインタンパク質によるロジックゲートの開発
Cage/Keyシステムを利用して、2重抗原陽性細胞を検出するシステム、Co-LOCKR を紹介します！
Articles 【デノボデザイン】バイオセンサータンパク質をデノボデザイン
デノボデザインで、任意のリガンドで活性をON/OFFできるバイオセンサーの開発した報告を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】分子最適化にも応用できるタンパク質バインダーデザイン手法EvoProとは
AF2とProteinMPNNの反復実行でタンパク質性のバインダーを生成するパイプラインEvoProについて紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】強化学習でタンパク質をトップダウン的にデザインする Science 論文
強化学習を用いて、タンパク質を、その全体構造を規定してトップダウン的に設計する手法を紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】拡散モデルで望みの2次構造をもつタンパク質をデザインする方法
拡散モデルを利用して、望みの2次構造の構成を示すタンパク質を生成する手法について紹介します。
Articles 【抗体デザイン】一般的なタンパク質言語モデルでも、抗体の親和性増強は可能なのです
タンパク質配列を学習した自然言語モデルを、抗体の分子進化に適用した論文を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】Dock＆Optimizeで、ゼロからIL-17Aに結合する抗体をデザインする手法
Dock and Optimize アプローチを採用した抗体のデノボデザイン手法を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】深層学習以前のバインダーデザイン手法をレビュー
バインダーに特化したタンパク質の計算化学的デザイン手法をレビューした論文を紹介します。