Uncategorized “graph neural PDE”で抗原結合抗体をデザイン、AbODEについて
抗原結合できる抗体の CDR を、計算機上でデザインできる AbODE という手法を紹介します！
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Uncategorized Articles 【抗体デザイン】AfDesignで抗体をデザイン！
AfDesign による "binder hallucination"を、抗体のCDRデザインに適用した事例を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】配列と構造を同時に生成できるタンパク質デザイン用の拡散モデル ProteinGeneratorについて
拡散モデルを利用したタンパク質生成モデルである ProteinGenerator を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】抗体の開発戦略全書
抗体医薬品の分子デザインに関わる技術をレビューした文献を紹介します！
Articles 【タンパク質構造予測】AF2を超える計算速度、RoseTTAFold”2″の威力について
タンパク質構造予測モデル RoseTTAFold の改良版、RoseTTAFold2 について紹介します！
Articles 【抗体言語モデル】構造情報を取り入れた抗体の言語モデルAbMAPでAF2越え
抗体構造情報を活用して、タンパク質言語モデルを転移学習させたモデル、AbMAP を紹介します！
Articles 【抗原デザイン】複数回膜貫通タンパク質を可溶型タンパク質としてデザイン、ツール分子のデザインに革命
天然の不溶性のタンパク質を、可溶性のタンパク質として発現できるように、配列を設計し直すための手法を紹介します！
3D model 【タンパク質構造予測】AF2全盛期における複合体予測手法の将来展望は
AF2前後のタンパク質複合体構造予測手法をまとめたレビュー論文を紹介します！
Articles 【総説】タンパク質複合体構造予測の現在地
タンパク質の複合体構造を予測する手法の課題について整理したレビュー論文を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】２次構造間に形成されるループの基本原則
タンパク質の２次構造間の配向や、間のループ構造の規則性について言及した論文を紹介します！