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【エピトープ予測】深層学習モデルを利用した抗体エピトープ予測手法を解説

抗体のエピトープを、既存の構造データセットを利用した深層学習モデルを活用して、予測する手法を提案している論文を紹介します。
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【ドッキング】実験情報を活用したタンパク質ドッキングシミュレーション手法(原著編)

事前に取得したエピトープ情報をもとに、抗体・抗原複合体構造のドッキングモデルを作成する手法について紹介します。
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【ドッキング】抗体・抗原相互作用における各ドッキングシミュレーション手法の精度を徹底比較

ドッキングシミュレーションの精度検証のためのベンチマークデータセットの作成と、それを用いた各ドッキングアルゴリズムの精度比較検証結果を紹介します。
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【ドッキング】実験情報を活用してドッキング精度を改善

実験データを活用してドッキングシミュレーションの精度を向上する手法について紹介します。
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【ドッキング】最新のドッキング手法を一挙に紹介

CASP-CAPRIの事例を中心に、タンパク質間相互作用を予測するドッキング手法の適応例と精度について紹介します。
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【LEGO】玩具と科学の融合

プラスチック製の組み立てブロック玩具であるLEGOの、バイオテクノロジーを含む科学分野への応用事例について紹介します。
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【抗体】従来のカノニカル構造を超える、構造情報を活用した新規CDR分類

抗体(CDR)の新規な分類データセットを紹介した論文を紹介します。
Foldit

【Foldit】HIV-TATペプチド

HIV-TATペプチドをFolditでモデリングしてみました。
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【バイオ×ゲーム】タンパク質構造予測ゲームFolditを紹介

タンパク質の正しいフォールディングを予想するオンラインゲームFolditの特徴や、プレイ履歴の解析結果などを紹介します。
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【Rosetta】PyRosettaとJupyter Notebookを活用したRosetta学習ツールの紹介

PyRosettaとJupyter Notebookを活用して、Rosettaの利用方法を学べるツールを紹介します。