Articles 【バインダーデザイン】結合特異性の高いタンパク質を、計算機でデザインするための方法論
既存の結合界面構造を出発点として、相同性の高いファミリー間で結合特異性のある分子を計算機でデザインした報告を紹介します。
Articles Articles 【バインダーデザイン】FFLを用いた結合モチーフのグラフティングで、バインダーを計算機デザイン
Bcl-2ホモログであるBHRF1に対するバインダーデザインを報告した論文を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】”target surface selection”で標的エピトープを同定しながらバインダーデザインへ
HAに対して結合するタンパク質をデノボデザインした実施例を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】IL-2 mimic な分子をデノボデザイン！
IL-2 mimicな分子をデノボスキャフォールドでデザインした実施例を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】多価抗原の複数エピトープに同時に結合できる、ホモオリゴマータンパク質をインシリコでデザイン！
多価抗原に対して同時に複数のエピトープに結合できるホモオリゴマーのデザイン手法を紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】遺伝子編集にも深層学習を適用！ZFDesignとは
任意のDNAに結合できるジンクフィンガー (ZF) ドメインを、深層学習モデルでデザインする手法ZFDesignを紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】逆折り畳み問題を精緻に解く
主鎖構造からの配列設計する逆折り畳み問題をを精緻する手法を紹介します。
Articles 【抗体デザイン】複合体構造がなくても、標的抗原に結合する抗体がデザインできる手法”dyMEAN”を紹介します
end-to-endで抗原に結合する抗体のH3をデザインする手法、dyMEANを開発を紹介します。
Articles 【TCR】「キャッチボンド」と「スリップボンド」
TCRとMHCペプチドの相互作用時に働く力学的な作用が、TCR/CD3シグナルに及ぼす影響を検証した論文を紹介します。
Articles 【エイジング】「老化時計」の今
老化度合いの指標となる、「老化時計」の測定方法について紹介します。