AlphaFold

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【抗体構造予測】AlphaFold3 の抗体・抗原複合体構造予測精度を詳細に評価

AlphaFold3 の抗体・抗原複合体構造予測精度を評価した論文を紹介します!
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【AF3】AlphaFold3の抗原・抗体複合体構造予測性能を徹底評価

AlphaFold3 による抗原・抗体複合体構造予測性能を評価した論文を紹介します!
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【AlphaFold】柔軟性の高い “disordered”領域の相互作用を解析するコツ

intrinsically disordered region に関する相互作用を、AlphaFold2 を使って解析する手法を紹介します!
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【AlphaFold】AlphaFoldを活用したペプチド性バインダーデザイン手法 EvoBind について

AlphaFold の点変異予測を活用したペプチドバインダーデザイン手法 EvoBind2 を紹介します!
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【AlphaFold】深層学習と物理化学アプローチを組み合わせたタンパク質複合体予測手法 AlphaREDとは

タンパク質複合体の構造予測手法である AlphaRED の開発を報告した論文を紹介します!
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【AlphaFold】相互作用ペアを高速に探索できる AlphaFastPPi を紹介!

タンパク質間相互作用解析ペアを探索するパイプライン AlphaFastPPi を紹介します!
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【AlphaFold】pAEを活用して新規タンパク質間相互作用を探索

AlphaFold-Multimer を利用して未知の相互作用ペアを探索するための評価指標 (LIS) を紹介します!
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AlphaFlow:構造アンサンブルを予測できる新手法を紹介

Flow matching を利用して、構造アンサンブルを予測する手法、AlphaFlow を紹介します!
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AlphaFold2を活用したタンパク質の多様な構造状態の予測

タンパク質の多状態構造を、MSA のクラスタリングと AlphaFold を利用して予測する AF-cluster という手法を紹介します!
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【AlphaFold2】AF2をリガンド結合サイト予測に利用 AF2BINDの実態

AlphaFold2(AF2)のペア表現を利用して、新しいモデルAF2BINDを訓練し、ターゲットとなるタンパク質だけを与えられた場合に、小分子の結合部位を正確に予測する手法を紹介します!