Articles 【相互作用予測】リガンド結合予測に、タンパク質の構造情報は必要？
深層学習を用いた、タンパク質・低分子リガンド間の相互作用強度予測モデルが、どのような特徴量を捉えて予測しているのか、検証した論文を紹介します！
AlphaFold
Articles Articles 【AlphaFold】抗体・抗原複合体予測の最新ベンチマーク
AlphaFold による抗体・抗原複合体モデルの予測精度について検証した論文を紹介します！
Articles 【AlphaFold】AlphaFold-multimer の予測精度を高める AFProfile の威力
AlphaFold の複合体構造を予測するモードである AlphaFold-multimer の予測精度を高めるための方法について紹介します！
3D model 【タンパク質構造予測】AF2全盛期における複合体予測手法の将来展望は
AF2前後のタンパク質複合体構造予測手法をまとめたレビュー論文を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】分子最適化にも応用できるタンパク質バインダーデザイン手法EvoProとは
AF2とProteinMPNNの反復実行でタンパク質性のバインダーを生成するパイプラインEvoProについて紹介します。
Articles 【AlphaFold】バインダーデザインの精度を向上させるAF2とProteinMPNNの役割
AF2やProteinMPNNを使うことで、バインダーのデザイン精度を向上させることができることを実証しています。
Articles 【構造予測】2億個のタンパク質のドメインを自動で分類するツール
タンパク質構造のドメイン分類を効率的に行う手法、DPAM(Domain Parser for AlphaFold Models)について紹介します。
Articles 【構造予測】あのAlphaFoldが、Google Colaboratoryで利用できる
AlphaFold2をGoogle Colaboratory環境で利用できる、ColabFoldについて紹介します。
Articles 【AlphaFold】複合体構造予測手法を利用して、複数のバインダーから高親和性の分子を同定
AlphaFoldを利用して、分子の競合的な結合の確認や、競合分子同士の親和性比較ができることを示した論文を紹介します。
Articles 【AlphaFold】De novo binder designも可能!? AlphaFold応用事例紹介
AlphaFoldを用いたタンパク質デザイン事例について紹介します。