Articles 【タンパク質デザイン】分子最適化にも応用できるタンパク質バインダーデザイン手法EvoProとは
AF2とProteinMPNNの反復実行でタンパク質性のバインダーを生成するパイプラインEvoProについて紹介します。
AlphaFold
Articles Articles 【AlphaFold】バインダーデザインの精度を向上させるAF2とProteinMPNNの役割
AF2やProteinMPNNを使うことで、バインダーのデザイン精度を向上させることができることを実証しています。
Articles 【構造予測】2億個のタンパク質のドメインを自動で分類するツール
タンパク質構造のドメイン分類を効率的に行う手法、DPAM(Domain Parser for AlphaFold Models)について紹介します。
Articles 【構造予測】あのAlphaFoldが、Google Colaboratoryで利用できる
AlphaFold2をGoogle Colaboratory環境で利用できる、ColabFoldについて紹介します。
Articles 【AlphaFold】複合体構造予測手法を利用して、複数のバインダーから高親和性の分子を同定
AlphaFoldを利用して、分子の競合的な結合の確認や、競合分子同士の親和性比較ができることを示した論文を紹介します。
Articles 【AlphaFold】De novo binder designも可能!? AlphaFold応用事例紹介
AlphaFoldを用いたタンパク質デザイン事例について紹介します。
Articles 【AlphaFold】深層学習によるタンパク質構造予測手法を利用した分子デザイン
AlphaFoldを利用したタンパク質デザイン手法について紹介します。