AlphaFold

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RFdiffusion3とAlphaFold3によるDNAバインダー設計

RFdiffusion3とAlphaFold3を組み合わせ、任意DNA配列を狙って識別するde novoタンパク質設計の成功率を大幅に高めた、DNAバインダー設計の新しい方向性を示す研究を紹介します!
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AlphaFold 3 を最大70倍高速化する「AlphaFast」:GPUでMSAを高速生成する新パイプライン

AlphaFold 3 の最大ボトルネックである MSA生成を GPU で高速化する「AlphaFast」の仕組みと性能を、論文内容に基づいて解説します!
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AlphaFoldを“ドッキングモデル”に変える:Flow Matchingで進化したAF2Dockとは

AlphaFold-MultimerをFlow Matchingで生成モデル化し、構造ベースドッキングへ転用したAF2Dockの設計思想と性能評価を解説します!
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AlphaFold3を組み込んだ高スループット抗体探索パイプライン

酵母ディスプレイとAlphaFold3を統合することで、複数標的に結合するVHH抗体を効率よく見つけ出す新しい抗体探索パイプラインを解説します!
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【AlphaFold】CASP16 での AF3 成績報告

ストックホルム大学からのCASP16の参加実績を紹介します!
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【抗体構造予測】AlphaFold3 の抗体・抗原複合体構造予測精度を詳細に評価

AlphaFold3 の抗体・抗原複合体構造予測精度を評価した論文を紹介します!
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【AF3】AlphaFold3の抗原・抗体複合体構造予測性能を徹底評価

AlphaFold3 による抗原・抗体複合体構造予測性能を評価した論文を紹介します!
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【AlphaFold】柔軟性の高い “disordered”領域の相互作用を解析するコツ

intrinsically disordered region に関する相互作用を、AlphaFold2 を使って解析する手法を紹介します!
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【AlphaFold】AlphaFoldを活用したペプチド性バインダーデザイン手法 EvoBind について

AlphaFold の点変異予測を活用したペプチドバインダーデザイン手法 EvoBind2 を紹介します!
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【AlphaFold】深層学習と物理化学アプローチを組み合わせたタンパク質複合体予測手法 AlphaREDとは

タンパク質複合体の構造予測手法である AlphaRED の開発を報告した論文を紹介します!