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【抗体デザイン】結合アッセイデータと天然性を指標に、活性の高い抗体配列をデザインする深層学習を紹介!

実験データと深層学習モデルの組み合わせで抗体の親和性増強を行う手法を紹介します!
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【抗体】抗体の抗原結合親和性を予測する深層学習モデル DG-Affinity とは。

抗体の抗原結合親和性を予測する深層学習モデル DG-Affinity を紹介します!
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【抗体デザイン】AB-Bind:抗体の変異体を解析したデータベースを紹介!

32種類の抗原抗体複合体、1101個の変異体のデータが格納されたデータベースである AB-Bind を利用して、抗体の変異デザインと活性の関係性について考察した論文を紹介します!
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【抗体デザイン】抗体に特化した配列設計モデル AbMPNN の実態

抗体に特化した逆折り畳み問題を解くモデル、AbMPNN を紹介します!
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【抗体デザイン】マスク言語モデルを用いた抗体の配列設計モデルを紹介!

マスク言語モデルを利用したタンパク質の配列設計手法を紹介します!抗原結合を伴う抗体の配列設計への適用を試みています。
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【抗体デザイン】ついにウェット試験で結合活性を示す抗体CDRをインシリコでデザイン!

IgDesign という手法で、抗原結合抗体をインシリコでデザインし、ウェットでその結合活性を確認した事例を紹介します!
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抗体ペアリングの新時代:エンコーダー・デコーダーモデルpAbT5の可能性

抗体の重鎖または軽鎖に対応するペア配列を生成できるモデル、pAbT5 を紹介します!
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【抗体デザイン】高度に類似した抗原に対して特異的なバインダーをインシリコでデザインするには

ファージディスプレイパニングで得られた配列情報を活用して訓練した機械学習モデルをもとに、訓練データに含まれていない仮想配列の抗原結合特性を予測する手法を紹介します!
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【抗体デザイン】Transformer で標的抗原に結合する抗体HCDR3をデザインする手法

望みの抗原に結合する CDRH3 を生成する PALM と、エピトープ配列と抗体配列から結合親和性を予測するモデル(A2binder)を紹介します!
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【抗体デザイン】多様な Ig ドメインライブラリを計算機で生成してみたところ・・・

安定で構造多様性のある、イムノグロブリンスキャフォールドライブラリを計算機でデザインした論文を紹介します!