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抗原ごとに賢く順位づける:In-Context Learningによる抗体親和性ランキング「AbICL」

抗原ごとの既知の親和性比較を「文脈」として活用することで、追加学習なしに抗体親和性ランキングを改善する新しいIn-Context Learningフレームワーク「AbICL」を紹介します!
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抗体の進化が明かす「エントレンチメント」について

抗体重鎖可変領域(IGHV)遺伝子間に存在するアミノ酸の違いが、「エントレンチメント(entrenchment)」と呼ばれる相互拘束の状態になっているかを調べた研究です!
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ESMFold2を使って10〜20分でナノボディを設計する ― EasyNanoが目指すエピトープ標的CDRデザイン

ESMFold2の距離分布予測を利用して特定エピトープに結合するナノボディCDRを約10〜20分で設計する、高速な計算抗体設計手法「EasyNano」を紹介します!
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抗体は成熟すると硬くなるのか?― 抗原タンパク質には剛直化、糖鎖には柔軟化という新しい法則

抗体成熟では一律な剛直化が起こるのではなく、タンパク質認識部位は硬くなり、糖鎖認識部位は柔軟になるという新しいダイナミクス原理を示した研究です。
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大規模抗体言語モデル「AbLingua」による構造を意識した抗体表現学習 ― 抗体工学のための新たな基盤モデル

4億件の抗体配列で学習した大規模抗体言語モデル「AbLingua」を解説します。独自のトリペプチド表現とスケーリング戦略によって、パラトープ予測、中和能予測、抗体設計など幅広い抗体工学タスクへの応用可能性を示した研究です!
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AF3-TurboAbとは? 抗体レパトアを“構造ごと”高速解読し、抗体設計を大規模化する新しい基盤技術

AlphaFold3を抗体レパトア全体へ拡張し、大規模かつ高速な構造予測を通じてエピトープ地図作成や実用的な抗体設計を加速する基盤技術 AF3-TruboAb について紹介します!
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GeoFlow-V3とは?最大50配列・3週間で抗体候補を見つける、迅速de novo抗体設計パイプラインの全体像

抗体-抗原複合体の構造予測とde novo抗体設計を統合した原子レベル拡散モデル「GeoFlow-V3」を紹介します!
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SEPIA:合成エピトープと大規模実験データで広げる、抗体デノボ設計のための構造学習基盤

合成エピトープ設計とAlphaSeq実験を組み合わせて2,600万件超の結合データを作り、抗体デノボ設計に不足していた大規模な正例・負例構造学習基盤を構築した研究を紹介します!
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AIが創薬を自動化する時代へ:自律型抗体設計エージェント「Latent-Y」を解説

テキスト指示だけで抗体やペプチドの設計から検証までを自律的に実行し、実験的に有効な分子を創出できるAIエージェント「Latent-Y」を紹介します!
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IgPose:生成データ拡張で抗体–抗原結合予測を強化する新しい計算フレームワーク

生成データ拡張と幾何学GNNを組み合わせ、抗体–抗原結合予測の精度と汎化性能を高めたIgPoseを解説します!