Articles 大規模抗体言語モデル「AbLingua」による構造を意識した抗体表現学習 ― 抗体工学のための新たな基盤モデル
4億件の抗体配列で学習した大規模抗体言語モデル「AbLingua」を解説します。独自のトリペプチド表現とスケーリング戦略によって、パラトープ予測、中和能予測、抗体設計など幅広い抗体工学タスクへの応用可能性を示した研究です！
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Articles AF3-TurboAbとは？ 抗体レパトアを“構造ごと”高速解読し、抗体設計を大規模化する新しい基盤技術
AlphaFold3を抗体レパトア全体へ拡張し、大規模かつ高速な構造予測を通じてエピトープ地図作成や実用的な抗体設計を加速する基盤技術 AF3-TruboAb について紹介します！
Articles GeoFlow-V3とは？最大50配列・3週間で抗体候補を見つける、迅速de novo抗体設計パイプラインの全体像
抗体-抗原複合体の構造予測とde novo抗体設計を統合した原子レベル拡散モデル「GeoFlow-V3」を紹介します！
Articles SEPIA：合成エピトープと大規模実験データで広げる、抗体デノボ設計のための構造学習基盤
合成エピトープ設計とAlphaSeq実験を組み合わせて2,600万件超の結合データを作り、抗体デノボ設計に不足していた大規模な正例・負例構造学習基盤を構築した研究を紹介します！
Articles AIが創薬を自動化する時代へ：自律型抗体設計エージェント「Latent-Y」を解説
テキスト指示だけで抗体やペプチドの設計から検証までを自律的に実行し、実験的に有効な分子を創出できるAIエージェント「Latent-Y」を紹介します！
Articles IgPose：生成データ拡張で抗体–抗原結合予測を強化する新しい計算フレームワーク
生成データ拡張と幾何学GNNを組み合わせ、抗体–抗原結合予測の精度と汎化性能を高めたIgPoseを解説します！
Articles Masked Language Modelをどう使いこなすか？抗体設計におけるサンプリング戦略の重要性
抗体設計において「モデルよりサンプリングが重要」という視点を提示した、実践的かつ示唆に富む研究を紹介します！
Articles 抗体と抗原の結合相手を配列から予測する：Contrastive Learning を使った CALM モデル
抗体配列と抗原配列の一次構造のみから、どの抗体がどの抗原に結合するかを予測するための機械学習モデル「CALM」を紹介します！
Articles 抗体–抗原構造予測の信頼性を検証した大規模ベンチマーク
ナノボディ–抗原複合体の大規模ベンチマークを構築し、AlphaFold3などの最新モデルの信頼度スコアが実際の結合特異性と相関するかを検証した論文を解説します！
Articles 抗体–抗原インターフェースに着目したADC活性予測モデル「ABFormer」の実力
抗体–抗原結合インターフェースを文脈的に埋め込み表現へと変換する Transformer ベースのモデル「ABFormer」を提案し、抗体薬物複合体（ADC）の活性予測精度を向上させています！