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【抗体言語モデル】構造情報を取り入れた抗体の言語モデルAbMAPでAF2越え

抗体構造情報を活用して、タンパク質言語モデルを転移学習させたモデル、AbMAP を紹介します!
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【抗体デザイン】一般的なタンパク質言語モデルでも、抗体の親和性増強は可能なのです

タンパク質配列を学習した自然言語モデルを、抗体の分子進化に適用した論文を紹介します!
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【抗体デザイン】Dock&Optimizeで、ゼロからIL-17Aに結合する抗体をデザインする手法

Dock and Optimize アプローチを採用した抗体のデノボデザイン手法を紹介します。
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【抗体デザイン】複合体構造がなくても、標的抗原に結合する抗体がデザインできる手法”dyMEAN”を紹介します

end-to-endで抗原に結合する抗体のH3をデザインする手法、dyMEANを開発を紹介します。
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【ALL】病因・疫学・診断・治療

ALLの病因・疫学・診断・治療について解説します。
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【細胞治療】造血幹細胞移植×抗体療法

造血幹細胞移植の前処理に使用される、抗体療法について紹介します。
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【抗体】新しい深層生成モデルでH3配列をサンプリング

multi-segment preserving samplingという深層生成モデルを提案して、抗体のH3デザインに応用した論文です。
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【BERT】SAR2-CoV-2 binderを深層学習で予測!AlphaSeqデータを用いたモデル学習

SAR2-CoV-2 binderを予測する深層学習モデルについて紹介します。
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【抗体デザイン】BERTとGNNを組み合わせた抗体のデザイン手法、AbBERT-HMPNとは

BERTとHMPNを接続して抗体のH3をデザインする手法、AbBERT-HMPNを紹介した論文を紹介します。
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【Pre-taining Language Model】抗体の事前学習言語モデルを総括!

抗体に特化した既知の自然言語事前学習モデル(Pre-trained Antibody Language Models, PALM) についてベンチマークし、一般的なタンパク質を訓練データとする事前学習モデル (Pre-trained Protein Language Models, PPLM) との違いについて考察した論文を紹介します。