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【バインダーデザイン】RifDock で TLR3 バインダーをデザイン

TLR3 に対するデノボバインダーデザインを実施した事例を紹介します!
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【タンパク質デザイン】最新アルゴリズムでバインダーデザインを最適化した事例を紹介

Direct Preference Optimization (DPO) を活用して、タンパク質のバインダーデザインを最適化する手法を紹介します!
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【AlphaFold】AlphaFold-multimer の予測精度を高める AFProfile の威力

AlphaFold の複合体構造を予測するモードである AlphaFold-multimer の予測精度を高めるための方法について紹介します!
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【タンパク質デザイン】配列モデルからペプチドバインダーデザイン

タンパク質の配列データを学習セットとして構築されたペプチドバインダーデザインモデルについて紹介します!
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【バインダーデザイン】深層学習以前のバインダーデザイン手法をレビュー

バインダーに特化したタンパク質の計算化学的デザイン手法をレビューした論文を紹介します。
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【バインダーデザイン】往年の結合タンパク質デザイン手法DDMIの活用例

インシリコバインダーデザインプロトコル、DDMIについての報告です。
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【バインダーデザイン】計算機で天然より優れた結合ネットワークをデザイン!

DNase(ColE7)とその免疫阻害タンパク質(Im7)の相互作用界面を計算機で最適化し、野生型タンパク質より優れた特異性を付与したデザイン事例を紹介します。
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【バインダーデザイン】結合特異性の高いタンパク質を、計算機でデザインするための方法論

既存の結合界面構造を出発点として、相同性の高いファミリー間で結合特異性のある分子を計算機でデザインした報告を紹介します。
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【バインダーデザイン】”target surface selection”で標的エピトープを同定しながらバインダーデザインへ

HAに対して結合するタンパク質をデノボデザインした実施例を紹介します。
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【バインダーデザイン】IL-2 mimic な分子をデノボデザイン!

IL-2 mimicな分子をデノボスキャフォールドでデザインした実施例を紹介します。