Articles 【タンパク質デザイン】分子最適化にも応用できるタンパク質バインダーデザイン手法EvoProとは
AF2とProteinMPNNの反復実行でタンパク質性のバインダーを生成するパイプラインEvoProについて紹介します。
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Articles Articles 【タンパク質デザイン】強化学習でタンパク質をトップダウン的にデザインする Science 論文
強化学習を用いて、タンパク質を、その全体構造を規定してトップダウン的に設計する手法を紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】拡散モデルで望みの2次構造をもつタンパク質をデザインする方法
拡散モデルを利用して、望みの2次構造の構成を示すタンパク質を生成する手法について紹介します。
Articles 【抗体デザイン】一般的なタンパク質言語モデルでも、抗体の親和性増強は可能なのです
タンパク質配列を学習した自然言語モデルを、抗体の分子進化に適用した論文を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】Dock＆Optimizeで、ゼロからIL-17Aに結合する抗体をデザインする手法
Dock and Optimize アプローチを採用した抗体のデノボデザイン手法を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】深層学習以前のバインダーデザイン手法をレビュー
バインダーに特化したタンパク質の計算化学的デザイン手法をレビューした論文を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】往年の結合タンパク質デザイン手法DDMIの活用例
インシリコバインダーデザインプロトコル、DDMIについての報告です。
Articles 【タンパク質デザイン】フレキシブルモチーフグラフティングの基礎
モチーフグラフティングの手法として、flexible backbone grafting を紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】従来の不連続エピトープグラフティング手法「マルチグラフトデザイン」とは
HIV gp120の不連続なエピトープを対象に、モチーフグラフティングを実施した事例を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】β-シート間相互作用で結合界面をデザイン
β-シート間相互作用で２量化するタンパク質を人工的にデザインした事例を紹介します。