Articles Genie 3とは何か？SE(3)等変性を“捨てずに進化”させた高速・高性能な次世代タンパク質デザインモデル
SE(3)等変性を維持したall-atom拡散モデルによって、タンパク質binder設計・motif scaffolding・新規構造生成を高速かつ高性能に進化させた次世代プロテインデザイン手法 Genie 3を紹介します！
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Articles evedesignとは？タンパク質設計AIを“つなぐ”統合基盤が目指す、誰でも使えるバイオシーケンス設計
進化モデル・言語モデル・構造モデルを共通仕様で組み合わせ、タンパク質・抗体・酵素設計をより再現性高く、柔軟に、そして非専門家にも使いやすくすることを目指した統合型バイオシーケンス設計基盤 evedesign を紹介します！
Articles 物理ベース設計と深層学習を組み合わせたCLAIREが切り拓くデノボ小分子バインダー設計
小分子結合タンパク質設計において、水素結合の精密配置を起点に物理ベース設計と深層学習を統合したCLAIREは、従来より高い実験成功率でデノボバインダー創出を実証した研究です！
Articles LLMがタンパク質設計を“考えながら改善する”：RosettaSearchの仕組みをやさしく解説
LLMを“設計者”ではなく“改善者”として使い、タンパク質配列を推論時に最適化する新しいアプローチを紹介します！
Articles 創薬を加速する統合モデル「Protenix-v2」とは？抗体設計と構造予測の最前線
抗体設計と構造予測を統合したProtenix-v2の仕組みと成果を解説します！
Articles タンパク質界面変異は「結合の強さ」だけでなく「品質」にも効いている？
抗体の親和性変化の多くは「結合」ではなく「タンパク質の品質」によるものだったことを、実験的に切り分けて示した重要な研究です！
Articles Surf2Spot：構造がなくても使える、表面情報ベースの結合ホットスポット予測モデル
タンパク質の単量体構造から相互作用ホットスポットを予測する深層学習モデル「Surf2Spot」を紹介します！
Articles 生成AI「Origin-1」による de novo 抗体設計の実証研究
ゼロ情報エピトープに対する抗体設計という難題に、生成AIでどこまで迫れるのかを実験的に示した研究を、初学者向けに解説します！
Articles 【タンパク質デザイン】T-cell engager の分子形もインシリコで最適化
高スループット機能アッセイと多目的ベイズ最適化を閉ループ統合し、抗原密度依存 avidity を設計原理として HER2×CD3 TCE の完全選択的活性を実現した論文を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】デノボデザインの統合パイプライン Ovo の構想とは
Ovo という、RFdiffusion 時代の de novo タンパク質設計を「個人芸」から「再現可能な工学プロセス」へ昇格させるための実践的オープンソース基盤を紹介します！