Articles 【レビュー】深層学習を活用したタンパク質デザイン手法を総括
深層学習を活用したタンパク質デザイン手法をレビューした論文を紹介します。
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Articles Articles 【タンパク質デザイン】タンパク質の計算機デザインに貢献した研究者たち
タンパク質をデノボでデザインするための研究を、歴史を追って概説したレビュー論文を紹介します（②）。
Articles 【タンパク質デザイン】タンパク質の計算機デザインの歴史を学ぶ
タンパク質をデノボでデザインするための研究を、歴史を追って概説したレビュー論文を紹介します。
Articles 【Rosetta】ヘリックス・ループのタンデム構造をパラメトリックにデザイン
ヘリックス・ループ・ヘリックス・ループのタンデム構造を、パラメトリックにデザインする手法を紹介します。
Articles 【配列デザイン】CNNでタンパク質の主鎖構造から配列をデザイン
タンパク質の主鎖構造から、深層学習を利用して、配列をデザインする手法について紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】MDシミュレーションで生成した訓練データを活用してMonobodyをデザイン
深層生成モデルを利用して、Monobody型のバインダーをデザインする手法"Sculptor"を紹介します。
Articles 【抗体】新しい深層生成モデルでH3配列をサンプリング
multi-segment preserving samplingという深層生成モデルを提案して、抗体のH3デザインに応用した論文です。
Articles 【AlphaFold】バインダーデザインの精度を向上させるAF2とProteinMPNNの役割
AF2やProteinMPNNを使うことで、バインダーのデザイン精度を向上させることができることを実証しています。
Articles 【抗体デザイン】BERTとGNNを組み合わせた抗体のデザイン手法、AbBERT-HMPNとは
BERTとHMPNを接続して抗体のH3をデザインする手法、AbBERT-HMPNを紹介した論文を紹介します。
Articles 【抗体デザイン】抗原に結合するH3をデノボでデザインできる手法が深層学習でついに誕生！
CDRの配列と３次元構造を同時に生成できるモデルMEANを紹介します。