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【拡散モデル】ベンチャー企業からも拡散モデルを用いたタンパク質デザイン手法が発表!その名は”Chroma”

拡散モデルを用いたタンパク質デザイン手法、Chromaを提案した論文を紹介します。
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【拡散モデル】ついにpico molarオーダーのバインダーをデザイン! RF diffusionのポテンシャル

拡散モデルを用いたタンパク質デザイン手法 RF diffusionを提案した論文を紹介します。
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Rosettaを用いたデノボタンパク質デザイン手法をレビュー

タンパク質のデノボデザインに有用な計算手法について概説されたレビュー論文を紹介します。
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Fold2Seqを抗体デザインに適用

Fold2Seqを抗体デザインに適用した事例を紹介します。
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Equivariant Neural Networksで抗体デザインに挑戦

抗原・抗体複合体のドッキング予測とデザインのため、Hierarchical Equivariant Refinement Network (HERN)を提案した論文を紹介します。
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【抗体デザイン】”Active Learning”を使って抗体設計に挑戦

抗体工学の予測・生成モデルに"active learning"を利用した実施例です。
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【抗体デザイン】拡散モデルを使って、抗原結合抗体をデノボデザイン

拡散モデルを用いた抗体のデザイン手法を提案している論文です。
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【抗体デザイン】抗体の構造・配列生成を反復的に精緻化する手法、RefineGNNについて

抗体の構造・配列生成を反復的に精緻化する手法、RefineGNNを紹介します。
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【抗体デザイン】Q学習を利用したH3の抗体最適化手法を紹介

Q学習による深層強化学習を利用して、抗体のデザインを試みた論文を紹介します。
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【de novoデザイン】ProteinSolverでデザインしたタンパク質をAlphaFold2で構造予測

ProteinSolverを用いてデザインしたタンパク質の評価指標の1つとして、AlphaFold2による予測構造を利用したデザイン事例を紹介します。