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【Lead Optimization】Active Learning を活用したタンパク質の分子進化手法を紹介

Active Learning を活用したタンパク質の分子進化手法を紹介します!
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【バインダーデザイン】低分子リガンド依存的な On-Switch バインダーがデザインできる、MaSIF の新規手法を紹介

低分子リガンドが結合したタンパク質表面をエピトープとするバインダーの設計手法 MaSIF-neosurf を紹介します!
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【ペプチドバインダーデザイン】拡散モデルを活用した多目的最適なペプチドバインダーの設計手法 PepTune とは

ペプチドバインダーのデノボデザイン手法 PepTune を紹介します!
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【タンパク質デザイン】GPT と ESM モデルを同時に訓練した生成モデルで抗菌ペプチドをデザイン

抗菌ペプチドやデヒドロゲナーゼなどの機能を持つタンパク質を生成するモデルを、GPT モデルのファインチューニングで構築した研究成果を示した論文を紹介します!
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【バインダーデザイン】ファージディスプレイの Enrichement ratio と true binder との相関性について

Inverse folding model を用いた Insulin receptor バインダーデザインの実施例を紹介します!
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【抗体デザイン】Contrastive Preference Optimization (CPO) を活用した大規模言語モデルのファインチューニング手法を紹介

Contrastive Preference Optimization (CPO) を活用してタンパク質言語モデルをファインチューニングし、抗体デザインに適用した事例を紹介します!
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【タンパク質デザイン】柔軟性の高い配列を生成できる ProteinMPNN の改良モデル、Flexpert を紹介!

タンパク質の柔軟性を予測し、柔軟性の高い配列を設計する手法 Flexpert を紹介します!
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【バインダーデザイン】peptide-MHC バインダーにはデノボスキャフォールドがおすすめ

peptide-MHC に対するバインダーをデノボで設計した実施例を紹介します!
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【抗体デザイン】抗原配列のみからデノボでVH/VL配列を生成するバインダーデザイン手法 MAGE を紹介

ウイルス抗原に対して LLM モデルで抗体をデノボ設計する手法 MAGE を紹介します!
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【抗体スクリーニング】独メルクから sdAb 取得プラットフォームの紹介

VHH 取得に NGS データに基づく LSTM ベースの配列生成モデルを活用した実施例を紹介します!