design

Articles

【タンパク質デザイン】変異効果を進化情報と溶媒露出度だけから予測する方法

変異によるタンパク質の性質変化予測を、残基保存性と溶媒露出度(RSA)のみから高い精度を実現できる、シンプルで解釈しやすいモデル「RSALOR」を紹介します!
Articles

【タンパク質デザイン】AlphaFold3レプリカを活用したバインダー設計手法 Boltzdesign1 を紹介

Boltz-1 を利用して、タンパク質バインダーを設計する新たな手法を紹介します。
Articles

【抗体最適化】抗体設計モデルの性能を比較評価するためのベンチマークフレームワークを紹介

抗体の結合親和性の成熟および設計を目的とした機械学習モデルの性能を評価するためのベンチマークフレームワーク「AbBiBench」を紹介します!
Articles

【タンパク質デザイン】プロテアーゼの基質配列を予測・生成するパイプライン CleaveNet を紹介

深層学習を用いてプロテアーゼ基質(特定のプロテアーゼによって切断されるペプチド)の設計を行う新しい AI パイプライン「CleaveNet」を提案・検証した研究です!
Articles

【抗体デザイン】pH 依存的に FcRn に結合するモノマー型 Fc のデザイン

モノマー型 Fc(mFc)を用いた新しい抗体・融合タンパク質設計のための構造工学研究を紹介します!
Articles

【抗体デザイン】AbLang を活用して ProteinMPNN の配列設計性能を改善

抗体言語モデルである AbLang の出力スコアを加味することで、ProteinMPNN の抗体配列設計性能を改善した報告を紹介します!
Articles

【抗体デザイン】sdAb のフレームワークに新規機能を付与する生成モデル TFDesign とは

拡散モデルベースの抗体に新規機能を付与する設計手法 TFDesign-sdAb を提案し、sdAb にProteinA 結合性を付与した応用例を紹介します!
Articles

【バインダーデザイン】Boltz-1を活用した新規デノボバインダーデザイン手法を紹介

全原子予測モデルを活用したバインダー設計手法 Boltzdesign1を紹介します!
Articles

【タンパク質デザイン】Adaptyv Bio のバインダーデザインコンペ結果報告

タンパク質のデザインコンペの結果報告を紹介します!
Articles

【抗体最適化】 Prescient Design の拡散モデルベースの抗体最適化手法 LaMBO-2 について解説

Discrete Diffusion Model を活用した抗体最適化手法 LaMBO-2 を紹介します!