Biotechnology 【RFDiffusion】バインダーデザインにおけるAF2スクリーニングのコツ
RFDiffusionでバインダーデザインするときのコツを紹介します！
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Articles Umolによる配列情報からのタンパク質-リガンド複合体の構造予測
Umol は、タンパク質の配列とリガンドを表す SMILES 文字列から、タンパク質-リガンド複合体の全原子構造を予測する AI システムを紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】リガンドペプチドでタンパク質の集積化を誘導
リガンドペプチドの結合によって、タンパク質間の集積化を誘導できるタンパク質のデザイン事例を紹介します！
Articles 【酵素デザイン】デノボデザインした酵素を計算化学でリデザインする方法
酵素をインシリコで改変デザインした事例を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】Chroma のコードが公開されました！
タンパク質のデザイン手法 Chroma の公開コードについて紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】突然変異の効果をインシリコで予測しやすいタンパク質の特徴とは
タンパク質の突然変異の効果を予測しにくい構造的特徴について紹介します！
Articles 【抗体デザイン】高度に類似した抗原に対して特異的なバインダーをインシリコでデザインするには
ファージディスプレイパニングで得られた配列情報を活用して訓練した機械学習モデルをもとに、訓練データに含まれていない仮想配列の抗原結合特性を予測する手法を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】Transformer で標的抗原に結合する抗体HCDR3をデザインする手法
望みの抗原に結合する CDRH3 を生成する PALM と、エピトープ配列と抗体配列から結合親和性を予測するモデル（A2binder）を紹介します！
Articles 【RFDiffusion】低分子に対するタンパク質バインダーを計算機で生成して構造予測！
複合体の構造予測やデザインを、非タンパク質性の分子にまで拡張した計算機手法、RoseTTAFold-All-Atom (RFAA) と RFdiffusion All-Atom (RFdiffusionAA) について解説した論文を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】多様な Ig ドメインライブラリを計算機で生成してみたところ・・・
安定で構造多様性のある、イムノグロブリンスキャフォールドライブラリを計算機でデザインした論文を紹介します！