language model

Articles

【抗体】インフルエンザ抗体のエピトープを予測する言語モデル mBLM について

抗体データセットに基づく深層学習大規模言語モデルを活用して、抗インフルエンザ HA 抗体の特性理解やエピトープ予測を行う手法を紹介します!
Articles

【抗体デザイン】インシリコデザインで、高度な特徴量の解析は不要

言語モデルとファージディスプレイパニングのデータを活用して、抗体の親和性増強のための改変探索を行う手法を紹介します!
Articles

【抗体モデル】最先端の構造予測モデル BALM について

Bio-inspired Antibody Language Model (BALM) と呼ばれる構造予測モデルを紹介します!
Articles

【相互作用予測】リガンド結合予測に、タンパク質の構造情報は必要?

深層学習を用いた、タンパク質・低分子リガンド間の相互作用強度予測モデルが、どのような特徴量を捉えて予測しているのか、検証した論文を紹介します!
Articles

【タンパク質デザイン】配列モデルからペプチドバインダーデザイン

タンパク質の配列データを学習セットとして構築されたペプチドバインダーデザインモデルについて紹介します!
Articles

【抗体言語モデル】構造情報を取り入れた抗体の言語モデルAbMAPでAF2越え

抗体構造情報を活用して、タンパク質言語モデルを転移学習させたモデル、AbMAP を紹介します!
Articles

【タンパク質デザイン】構造情報が与えられた言語モデルを用いて、タンパク質デザイン

言語モデルにタンパク質の構造情報を与えることで、タンパク質デザイン(配列設計)に応用できるモデル(LMDesign)について解説します!
Articles

【抗体デザイン】「抗体」と「自然言語」の共通点と相違点

言語学的特性をもとに、抗体に存在する規則を発見するために重要な要素を解説した論文を紹介します。