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AlphaFlow:構造アンサンブルを予測できる新手法を紹介

Flow matching を利用して、構造アンサンブルを予測する手法、AlphaFlow を紹介します!
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【タンパク質構造予測】超巨大なタンパク質複合体構造を予測できるモデルを紹介します!

6つ以上のタンパク質鎖複合体の構造を高効率に予測できる、AFM-RL を紹介します!
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世の中に存在する複合体タンパク質の構造を徹底解剖!

生体内に存在するホモオリゴマータンパク質を網羅的に検出して、体系的にその構造や機能、疾患との関連性を考察した論文を紹介します!
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【抗体】抗体の抗原結合親和性を予測する深層学習モデル DG-Affinity とは。

抗体の抗原結合親和性を予測する深層学習モデル DG-Affinity を紹介します!
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【抗体デザイン】AB-Bind:抗体の変異体を解析したデータベースを紹介!

32種類の抗原抗体複合体、1101個の変異体のデータが格納されたデータベースである AB-Bind を利用して、抗体の変異デザインと活性の関係性について考察した論文を紹介します!
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AIベースのドッキング手法は、物理的に妥当なポーズの生成や新規配列への一般化が難しいかも?

物理・化学的な指標をもとに既存のドッキング予測手法をベンチマークするための評価パッケージ PoseBusters について紹介します!
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【FragFold】AlphaFoldを使用した阻害タンパク質断片の高速計算手法を開発!

AlphaFold を用いてタンパク質断片がターゲットタンパク質に結合・阻害するかどうかを予測する新しい方法、FragFold について紹介します!
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リガンド結合部位を予測する DeepProSite について解説します!

タンパク質のリガンド結合部位を予測する手法 DeepProSite について紹介します!
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抗体ペアリングの新時代:エンコーダー・デコーダーモデルpAbT5の可能性

抗体の重鎖または軽鎖に対応するペア配列を生成できるモデル、pAbT5 を紹介します!
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リガンド結合親和性予測のためのアクティブラーニングプロトコルのベンチマーク

アクティブラーニングを利用した低分子リガンドと標的タンパク質の結合親和性予測手法について、その精度をベンチマークした論文を紹介します!