Articles 【抗体デザイン】AB-Bind：抗体の変異体を解析したデータベースを紹介！
32種類の抗原抗体複合体、1101個の変異体のデータが格納されたデータベースである AB-Bind を利用して、抗体の変異デザインと活性の関係性について考察した論文を紹介します！
prediction
Articles 
Articles AIベースのドッキング手法は、物理的に妥当なポーズの生成や新規配列への一般化が難しいかも？
物理・化学的な指標をもとに既存のドッキング予測手法をベンチマークするための評価パッケージ PoseBusters について紹介します！
Articles 【FragFold】AlphaFoldを使用した阻害タンパク質断片の高速計算手法を開発！
AlphaFold を用いてタンパク質断片がターゲットタンパク質に結合・阻害するかどうかを予測する新しい方法、FragFold について紹介します！
Articles リガンド結合部位を予測する DeepProSite について解説します！
タンパク質のリガンド結合部位を予測する手法 DeepProSite について紹介します！
Articles 抗体ペアリングの新時代：エンコーダー・デコーダーモデルpAbT5の可能性
抗体の重鎖または軽鎖に対応するペア配列を生成できるモデル、pAbT5 を紹介します！
Articles リガンド結合親和性予測のためのアクティブラーニングプロトコルのベンチマーク
アクティブラーニングを利用した低分子リガンドと標的タンパク質の結合親和性予測手法について、その精度をベンチマークした論文を紹介します！
Articles 現在の結合親和性予測モデルは、どんな特徴を学習しているのか
結合親和性予測のための既存の機械学習モデルが、どのような特徴量を用いて親和性を予測しているのか、そのメカニズムについて解析した論文を紹介します！
Articles タンパク質言語モデルの民主化：効率的なパラメータファインチューニング
タンパク質言語モデルに対するパラメータ効率的なファインチューニング手法を紹介します！
Articles 多重配列アラインメントを使用しないタンパク質構造予測の新手法
PLM と AlphaFold の手法を活用したタンパク質構造予測モデル HelixFold を紹介します！
Articles 【RFDiffusion】低分子に対するタンパク質バインダーを計算機で生成して構造予測！
複合体の構造予測やデザインを、非タンパク質性の分子にまで拡張した計算機手法、RoseTTAFold-All-Atom (RFAA) と RFdiffusion All-Atom (RFdiffusionAA) について解説した論文を紹介します！