Articles 現在の結合親和性予測モデルは、どんな特徴を学習しているのか
結合親和性予測のための既存の機械学習モデルが、どのような特徴量を用いて親和性を予測しているのか、そのメカニズムについて解析した論文を紹介します！
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Articles タンパク質言語モデルの民主化：効率的なパラメータファインチューニング
タンパク質言語モデルに対するパラメータ効率的なファインチューニング手法を紹介します！
Articles 多重配列アラインメントを使用しないタンパク質構造予測の新手法
PLM と AlphaFold の手法を活用したタンパク質構造予測モデル HelixFold を紹介します！
Articles 【RFDiffusion】低分子に対するタンパク質バインダーを計算機で生成して構造予測！
複合体の構造予測やデザインを、非タンパク質性の分子にまで拡張した計算機手法、RoseTTAFold-All-Atom (RFAA) と RFdiffusion All-Atom (RFdiffusionAA) について解説した論文を紹介します！
Articles 【相互作用予測】リガンド結合予測に、タンパク質の構造情報は必要？
深層学習を用いた、タンパク質・低分子リガンド間の相互作用強度予測モデルが、どのような特徴量を捉えて予測しているのか、検証した論文を紹介します！
Articles 【AlphaFold】AlphaFold-multimer の予測精度を高める AFProfile の威力
AlphaFold の複合体構造を予測するモードである AlphaFold-multimer の予測精度を高めるための方法について紹介します！
Articles 【タンパク質構造予測】AF2を超える計算速度、RoseTTAFold”2″の威力について
タンパク質構造予測モデル RoseTTAFold の改良版、RoseTTAFold2 について紹介します！
3D model 【タンパク質構造予測】AF2全盛期における複合体予測手法の将来展望は
AF2前後のタンパク質複合体構造予測手法をまとめたレビュー論文を紹介します！
Articles 【総説】タンパク質複合体構造予測の現在地
タンパク質の複合体構造を予測する手法の課題について整理したレビュー論文を紹介します！
Articles Graph Attention Networksを利用したエピトープ・パラトープ予測手法 PECAN
筆者らは、抗体と抗原の両方の結合界面（パラトープとエピトープ）を予測できる、グラフニューラルネットワークを利用した深層学習フレームワーク (PECAN) について紹介します。