Articles 【de novo design】またしてもタンパク質デザインのレビューを読み解く②
タンパク質のin silico構造予測・デザイン手法をまとめた総説を紹介します。この記事では、デザインを中心に解説します。
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Articles Articles 【de novo design】またしてもタンパク質デザインのレビューを読み解く①
タンパク質のin silico構造予測・デザイン手法をまとめた総説を紹介します。この記事では、構造予測を中心に解説します。
Articles 【Rosetta】エネルギーランドスケープの重要性と、trRosettaの威力
trRosettaによるタンパク質デザイン手法が、大域的なエネルギーランドスケープに対して最適な構造を提案する能力があることを示した論文を紹介します。
Articles 【Rosetta】深層学習構造予測モデルtrRosettaの実態
タンパク質構造予測手法のひとつであるtrRosettaと、予測における残基間配向の重要性について紹介します。
Articles 【エピトープ予測】深層学習モデルを利用した抗体エピトープ予測手法を解説
抗体のエピトープを、既存の構造データセットを利用した深層学習モデルを活用して、予測する手法を提案している論文を紹介します。
Articles 【ドッキング】実験情報を活用したタンパク質ドッキングシミュレーション手法（原著編）
事前に取得したエピトープ情報をもとに、抗体・抗原複合体構造のドッキングモデルを作成する手法について紹介します。
Articles 【抗体モデリング】抗体に特化した側鎖構造予測手法PEARSについて
抗体の側鎖構造を予測するツールであるPEARSを紹介します。
Articles 【抗体スクリーニング】天然配列へのback mutationで、抗体のdevelopabilityが改善
不溶性を示す物性の悪い抗体に対して、計算予測で物性を改善する変異体のデザインに成功した論文を紹介します。
Articles 【抗体エンジニアリング】抗体のdevelopabilityに関与する物性指標とは
メルクの非臨床における抗体スクリーニングのプラットフォームと、それを活用した各種物性評価指標の相関に関する解析結果を紹介します。
Articles 【抗体デザイン】in silicoで抗体の物理学的性質を予測する手法を解説③
抗体の物理学的性質をin silicoで予想する手法を紹介します。