protein language model

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【抗体デザイン】Sparse Autoencoder (SAE) を利用して抗体 LLM の理解を深める

抗体言語モデル(p-IgGen)の内部表現を Sparse Autoencoder(SAE)で分解することで、「解釈できる特徴」と「生成を実際に制御できる特徴」は別物であることを示した論文を紹介します!
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【抗体デザイン】抗体特化のPLMは、その他のモデルと何が違うのか

Protein Language Model(PLM)の「アーキテクチャや事前学習の違い」が、抗体特異的な生物学的特徴(CDR、V遺伝子、SHMなど)をどのようなバイアスとして学習させているのか?という問いに答える検証結果を紹介します!
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【タンパク質デザイン】pLM を DPO で条件付けする方法

タンパク質言語モデル (pLMs) に強化学習 (RL) を組み合わせることで、従来の限界を突破し、狙った性質を持つタンパク質配列を効率的に設計する手法 DPO_pLM を紹介します!