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デノボタンパク質デザインにより、ナノポアタンパク質のサイズと形状を自由自在に

新規プロテインデザインを使用して、特定のサイズと形状を持つ伝導性ナノポアを創出した研究を紹介します!
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【FragFold】AlphaFoldを使用した阻害タンパク質断片の高速計算手法を開発!

AlphaFold を用いてタンパク質断片がターゲットタンパク質に結合・阻害するかどうかを予測する新しい方法、FragFold について紹介します!
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リガンド結合部位を予測する DeepProSite について解説します!

タンパク質のリガンド結合部位を予測する手法 DeepProSite について紹介します!
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【タンパク質デザイン】構造配列プロファイルを活用した配列設計の新規手法 SPDesign とは

逆折り畳み問題を解く新規手法である SPDesign を紹介します!
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大規模データセットを用いたタンパク質安定性予測手法

タンパク質の熱安定性を予測する言語モデル「ESM_therm」を紹介します!
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【タンパク質構造解析】CASP15で好成績を収めたDeepFoldを深掘り!

DeepFold という名の新しいタンパク質構造予測モデルについて紹介します!タンパク質の側鎖とバックボーンの精度を高めるために、損失関数とテンプレート機能、エネルギー関数に最適化の工夫がみられます。
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【タンパク質構造予測】単一配列からのタンパク質構造予測におけるColabFoldの革新

本論文では、ColabFold に標的のタンパク質配列を投げるだけで、タンパク質の代替構造を予測できることを示した論文を紹介します!
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現在の結合親和性予測モデルは、どんな特徴を学習しているのか

結合親和性予測のための既存の機械学習モデルが、どのような特徴量を用いて親和性を予測しているのか、そのメカニズムについて解析した論文を紹介します!
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【RFDiffusion】バインダーデザインにおけるAF2スクリーニングのコツ

RFDiffusionでバインダーデザインするときのコツを紹介します!
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タンパク質言語モデルの民主化:効率的なパラメータファインチューニング

タンパク質言語モデルに対するパラメータ効率的なファインチューニング手法を紹介します!