Articles インテグリン非依存的にTie2を活性化するデノボ設計タンパク質の開発
RFdiffusionを用いて設計されたTie2特異的ミニバインダーH8mbが、インテグリン非依存的にTie2を活性化し、血管バリア機能の改善とARDSモデルマウスの生存率向上を示した研究を紹介します！
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Articles 巨大実験データで進化したタンパク質安定性予測―― 180万件規模の測定データから生まれた「ESM3ΔG」「SaProtΔG」
180万件規模の実験データを使って、タンパク質の絶対安定性を高精度に予測する「ESM3ΔG」「SaProtΔG」を開発した研究を解説します！
Articles Genie 3とは何か？SE(3)等変性を“捨てずに進化”させた高速・高性能な次世代タンパク質デザインモデル
SE(3)等変性を維持したall-atom拡散モデルによって、タンパク質binder設計・motif scaffolding・新規構造生成を高速かつ高性能に進化させた次世代プロテインデザイン手法 Genie 3を紹介します！
Articles BioKinemaとは何か？ 全原子レベルで「分子の動き」を生成する、物理法則ベースの生体分子ダイナクス基盤
物理法則に基づく時間attentionと階層的拡散生成によって、全原子レベルの生体分子ダイナクスを高速に再現しようとする、新しいMD代替候補モデル BioKinema を紹介します！
Articles evedesignとは？タンパク質設計AIを“つなぐ”統合基盤が目指す、誰でも使えるバイオシーケンス設計
進化モデル・言語モデル・構造モデルを共通仕様で組み合わせ、タンパク質・抗体・酵素設計をより再現性高く、柔軟に、そして非専門家にも使いやすくすることを目指した統合型バイオシーケンス設計基盤 evedesign を紹介します！
Articles 物理ベース設計と深層学習を組み合わせたCLAIREが切り拓くデノボ小分子バインダー設計
小分子結合タンパク質設計において、水素結合の精密配置を起点に物理ベース設計と深層学習を統合したCLAIREは、従来より高い実験成功率でデノボバインダー創出を実証した研究です！
Articles LLMがタンパク質設計を“考えながら改善する”：RosettaSearchの仕組みをやさしく解説
LLMを“設計者”ではなく“改善者”として使い、タンパク質配列を推論時に最適化する新しいアプローチを紹介します！
Articles 創薬を加速する統合モデル「Protenix-v2」とは？抗体設計と構造予測の最前線
抗体設計と構造予測を統合したProtenix-v2の仕組みと成果を解説します！
Articles タンパク質界面変異は「結合の強さ」だけでなく「品質」にも効いている？
抗体の親和性変化の多くは「結合」ではなく「タンパク質の品質」によるものだったことを、実験的に切り分けて示した重要な研究です！
Articles AIがタンパク質のリード最適化を自動化する：CRADLE-1によるタンパク質エンジニアリング
タンパク質のリード最適化を自動化する機械学習システム「CRADLE-1」の仕組みと実験結果を解説します！