protein

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【バインダーデザイン】FFLを用いた結合モチーフのグラフティングで、バインダーを計算機デザイン

Bcl-2ホモログであるBHRF1に対するバインダーデザインを報告した論文を紹介します。
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【バインダーデザイン】”target surface selection”で標的エピトープを同定しながらバインダーデザインへ

HAに対して結合するタンパク質をデノボデザインした実施例を紹介します。
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【バインダーデザイン】IL-2 mimic な分子をデノボデザイン!

IL-2 mimicな分子をデノボスキャフォールドでデザインした実施例を紹介します。
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【バインダーデザイン】多価抗原の複数エピトープに同時に結合できる、ホモオリゴマータンパク質をインシリコでデザイン!

多価抗原に対して同時に複数のエピトープに結合できるホモオリゴマーのデザイン手法を紹介します。
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【タンパク質デザイン】遺伝子編集にも深層学習を適用!ZFDesignとは

任意のDNAに結合できるジンクフィンガー (ZF) ドメインを、深層学習モデルでデザインする手法ZFDesignを紹介します。
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【タンパク質デザイン】逆折り畳み問題を精緻に解く

主鎖構造からの配列設計する逆折り畳み問題をを精緻する手法を紹介します。
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【タンパク質デザイン】酵素の合理的または計算機によるデザイン手法を紹介

酵素を、"Rational"または"Computational"にデザインするための手法を紹介します。
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【レビュー論文】Rational protein designとは。ヘリックスバンドルを事例に紹介します

ヘリックス構造を事例に熱力学的な視点をメインに、構造決定に重要な原理を解説したレビュー論文です。
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Minimal protein designとは②

αヘリックスデザインを中心に、Minimal protein designの手法や技術開発の歴史を解説します。
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Minimal protein designとは①

αヘリックスデザインを中心に、Minimal protein designの手法や技術開発の歴史を解説します。